Protein–RNA interactions for Protein: O14545

TRAFD1, TRAF-type zinc finger domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 582 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAFD1O14545 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TRAFD1O14545 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TRAFD1O14545 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TRAFD1O14545 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TRAFD1O14545 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
TRAFD1O14545 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TRAFD1O14545 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TRAFD1O14545 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
TRAFD1O14545 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TRAFD1O14545 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TRAFD1O14545 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TRAFD1O14545 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
TRAFD1O14545 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TRAFD1O14545 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TRAFD1O14545 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TRAFD1O14545 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TRAFD1O14545 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TRAFD1O14545 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TRAFD1O14545 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TRAFD1O14545 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TRAFD1O14545 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TRAFD1O14545 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TRAFD1O14545 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TRAFD1O14545 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TRAFD1O14545 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TRAFD1O14545 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TRAFD1O14545 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TRAFD1O14545 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TRAFD1O14545 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TRAFD1O14545 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TRAFD1O14545 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TRAFD1O14545 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TRAFD1O14545 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TRAFD1O14545 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TRAFD1O14545 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
TRAFD1O14545 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
TRAFD1O14545 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC21.52■■□□□ 1.03
TRAFD1O14545 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TRAFD1O14545 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TRAFD1O14545 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TRAFD1O14545 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TRAFD1O14545 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TRAFD1O14545 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TRAFD1O14545 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TRAFD1O14545 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TRAFD1O14545 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
TRAFD1O14545 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TRAFD1O14545 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TRAFD1O14545 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TRAFD1O14545 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TRAFD1O14545 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TRAFD1O14545 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TRAFD1O14545 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TRAFD1O14545 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TRAFD1O14545 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TRAFD1O14545 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TRAFD1O14545 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TRAFD1O14545 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TRAFD1O14545 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TRAFD1O14545 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TRAFD1O14545 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TRAFD1O14545 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TRAFD1O14545 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TRAFD1O14545 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TRAFD1O14545 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TRAFD1O14545 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TRAFD1O14545 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
TRAFD1O14545 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TRAFD1O14545 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TRAFD1O14545 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TRAFD1O14545 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TRAFD1O14545 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TRAFD1O14545 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TRAFD1O14545 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TRAFD1O14545 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TRAFD1O14545 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TRAFD1O14545 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TRAFD1O14545 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TRAFD1O14545 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TRAFD1O14545 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TRAFD1O14545 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
TRAFD1O14545 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TRAFD1O14545 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TRAFD1O14545 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TRAFD1O14545 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
TRAFD1O14545 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TRAFD1O14545 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TRAFD1O14545 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TRAFD1O14545 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TRAFD1O14545 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TRAFD1O14545 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TRAFD1O14545 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TRAFD1O14545 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TRAFD1O14545 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TRAFD1O14545 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TRAFD1O14545 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TRAFD1O14545 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TRAFD1O14545 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TRAFD1O14545 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TRAFD1O14545 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
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