Protein–RNA interactions for Protein: O00443

PIK3C2A, Phosphatidylinositol 4-phosphate 3-kinase C2 domain-containing subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 1,686 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIK3C2AO00443 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
PIK3C2AO00443 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
PIK3C2AO00443 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
PIK3C2AO00443 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
PIK3C2AO00443 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
PIK3C2AO00443 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
PIK3C2AO00443 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
PIK3C2AO00443 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
PIK3C2AO00443 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
PIK3C2AO00443 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
PIK3C2AO00443 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
PIK3C2AO00443 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
PIK3C2AO00443 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
PIK3C2AO00443 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
PIK3C2AO00443 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
PIK3C2AO00443 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
PIK3C2AO00443 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
PIK3C2AO00443 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
PIK3C2AO00443 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
PIK3C2AO00443 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
PIK3C2AO00443 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
PIK3C2AO00443 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
PIK3C2AO00443 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
PIK3C2AO00443 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
PIK3C2AO00443 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
PIK3C2AO00443 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
PIK3C2AO00443 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
PIK3C2AO00443 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
PIK3C2AO00443 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC28.48■■■□□ 2.15
PIK3C2AO00443 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
PIK3C2AO00443 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
PIK3C2AO00443 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
PIK3C2AO00443 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
PIK3C2AO00443 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
PIK3C2AO00443 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
PIK3C2AO00443 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
PIK3C2AO00443 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
PIK3C2AO00443 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
PIK3C2AO00443 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC28.47■■■□□ 2.15
PIK3C2AO00443 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC28.47■■■□□ 2.15
PIK3C2AO00443 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
PIK3C2AO00443 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC28.47■■■□□ 2.15
PIK3C2AO00443 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
PIK3C2AO00443 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
PIK3C2AO00443 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
PIK3C2AO00443 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
PIK3C2AO00443 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.46■■■□□ 2.15
PIK3C2AO00443 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC28.46■■■□□ 2.15
PIK3C2AO00443 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC28.46■■■□□ 2.15
PIK3C2AO00443 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
PIK3C2AO00443 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC28.46■■■□□ 2.15
PIK3C2AO00443 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
PIK3C2AO00443 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
PIK3C2AO00443 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
PIK3C2AO00443 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
PIK3C2AO00443 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.15
PIK3C2AO00443 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC28.45■■■□□ 2.15
PIK3C2AO00443 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.15
PIK3C2AO00443 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
PIK3C2AO00443 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
PIK3C2AO00443 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
PIK3C2AO00443 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC28.45■■■□□ 2.14
PIK3C2AO00443 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC28.45■■■□□ 2.14
PIK3C2AO00443 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
PIK3C2AO00443 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
PIK3C2AO00443 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
PIK3C2AO00443 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
PIK3C2AO00443 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
PIK3C2AO00443 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
PIK3C2AO00443 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
PIK3C2AO00443 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
PIK3C2AO00443 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
PIK3C2AO00443 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
PIK3C2AO00443 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
PIK3C2AO00443 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
PIK3C2AO00443 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
PIK3C2AO00443 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
PIK3C2AO00443 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
PIK3C2AO00443 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
PIK3C2AO00443 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
PIK3C2AO00443 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
PIK3C2AO00443 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
PIK3C2AO00443 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
PIK3C2AO00443 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
PIK3C2AO00443 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC28.43■■■□□ 2.14
PIK3C2AO00443 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
PIK3C2AO00443 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC28.43■■■□□ 2.14
PIK3C2AO00443 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
PIK3C2AO00443 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
PIK3C2AO00443 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
PIK3C2AO00443 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
PIK3C2AO00443 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
PIK3C2AO00443 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
PIK3C2AO00443 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
PIK3C2AO00443 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
PIK3C2AO00443 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
PIK3C2AO00443 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
PIK3C2AO00443 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
PIK3C2AO00443 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
PIK3C2AO00443 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms