Protein–RNA interactions for Protein: J3QKU1

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 62 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
J3QKU1 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
J3QKU1 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
J3QKU1 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
J3QKU1 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
J3QKU1 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
J3QKU1 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
J3QKU1 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC18.72■□□□□ 0.59
J3QKU1 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
J3QKU1 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC18.72■□□□□ 0.59
J3QKU1 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC18.72■□□□□ 0.59
J3QKU1 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
J3QKU1 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
J3QKU1 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
J3QKU1 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
J3QKU1 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
J3QKU1 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
J3QKU1 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
J3QKU1 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
J3QKU1 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
J3QKU1 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
J3QKU1 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
J3QKU1 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
J3QKU1 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
J3QKU1 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
J3QKU1 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
J3QKU1 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
J3QKU1 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
J3QKU1 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.58
J3QKU1 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
J3QKU1 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
J3QKU1 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
J3QKU1 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
J3QKU1 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
J3QKU1 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
J3QKU1 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
J3QKU1 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
J3QKU1 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
J3QKU1 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
J3QKU1 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
J3QKU1 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
J3QKU1 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
J3QKU1 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
J3QKU1 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
J3QKU1 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
J3QKU1 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
J3QKU1 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
J3QKU1 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
J3QKU1 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
J3QKU1 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
J3QKU1 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
J3QKU1 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
J3QKU1 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
J3QKU1 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
J3QKU1 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
J3QKU1 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
J3QKU1 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
J3QKU1 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
J3QKU1 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
J3QKU1 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
J3QKU1 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
J3QKU1 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
J3QKU1 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
J3QKU1 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
J3QKU1 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
J3QKU1 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
J3QKU1 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
J3QKU1 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
J3QKU1 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
J3QKU1 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
J3QKU1 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
J3QKU1 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
J3QKU1 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
J3QKU1 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
J3QKU1 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
J3QKU1 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC18.69■□□□□ 0.58
J3QKU1 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
J3QKU1 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
J3QKU1 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
J3QKU1 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
J3QKU1 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
J3QKU1 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
J3QKU1 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
J3QKU1 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
J3QKU1 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
J3QKU1 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
J3QKU1 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
J3QKU1 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
J3QKU1 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
J3QKU1 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
J3QKU1 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
J3QKU1 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
J3QKU1 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
J3QKU1 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
J3QKU1 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
J3QKU1 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
J3QKU1 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
J3QKU1 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
J3QKU1 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
J3QKU1 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
J3QKU1 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms