Protein–RNA interactions for Protein: C9JL84

HHLA1, HERV-H LTR-associating protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HHLA1C9JL84 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
HHLA1C9JL84 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
HHLA1C9JL84 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
HHLA1C9JL84 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HHLA1C9JL84 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
HHLA1C9JL84 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HHLA1C9JL84 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
HHLA1C9JL84 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
HHLA1C9JL84 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HHLA1C9JL84 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HHLA1C9JL84 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HHLA1C9JL84 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HHLA1C9JL84 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
HHLA1C9JL84 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
HHLA1C9JL84 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
HHLA1C9JL84 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
HHLA1C9JL84 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
HHLA1C9JL84 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
HHLA1C9JL84 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
HHLA1C9JL84 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
HHLA1C9JL84 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HHLA1C9JL84 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HHLA1C9JL84 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HHLA1C9JL84 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HHLA1C9JL84 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HHLA1C9JL84 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HHLA1C9JL84 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HHLA1C9JL84 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HHLA1C9JL84 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
HHLA1C9JL84 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HHLA1C9JL84 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HHLA1C9JL84 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
HHLA1C9JL84 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HHLA1C9JL84 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HHLA1C9JL84 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
HHLA1C9JL84 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
HHLA1C9JL84 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
HHLA1C9JL84 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
HHLA1C9JL84 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
HHLA1C9JL84 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
HHLA1C9JL84 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
HHLA1C9JL84 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
HHLA1C9JL84 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
HHLA1C9JL84 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
HHLA1C9JL84 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HHLA1C9JL84 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
HHLA1C9JL84 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
HHLA1C9JL84 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HHLA1C9JL84 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HHLA1C9JL84 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
HHLA1C9JL84 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
HHLA1C9JL84 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
HHLA1C9JL84 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
HHLA1C9JL84 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HHLA1C9JL84 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HHLA1C9JL84 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HHLA1C9JL84 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HHLA1C9JL84 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HHLA1C9JL84 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
HHLA1C9JL84 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HHLA1C9JL84 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
HHLA1C9JL84 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HHLA1C9JL84 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
HHLA1C9JL84 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
HHLA1C9JL84 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
HHLA1C9JL84 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HHLA1C9JL84 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
HHLA1C9JL84 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
HHLA1C9JL84 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HHLA1C9JL84 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
HHLA1C9JL84 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
HHLA1C9JL84 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HHLA1C9JL84 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
HHLA1C9JL84 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HHLA1C9JL84 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HHLA1C9JL84 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HHLA1C9JL84 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
HHLA1C9JL84 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HHLA1C9JL84 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
HHLA1C9JL84 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
HHLA1C9JL84 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
HHLA1C9JL84 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
HHLA1C9JL84 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HHLA1C9JL84 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HHLA1C9JL84 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
HHLA1C9JL84 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HHLA1C9JL84 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
HHLA1C9JL84 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
HHLA1C9JL84 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
HHLA1C9JL84 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
HHLA1C9JL84 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
HHLA1C9JL84 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
HHLA1C9JL84 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
HHLA1C9JL84 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
HHLA1C9JL84 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
HHLA1C9JL84 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
HHLA1C9JL84 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
HHLA1C9JL84 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
HHLA1C9JL84 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
HHLA1C9JL84 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.4 ms