Protein–RNA interactions for Protein: B6SEH8

ERVV-1, Endogenous retrovirus group V member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 477 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVV-1B6SEH8 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC26.49■■□□□ 1.83
ERVV-1B6SEH8 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
ERVV-1B6SEH8 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
ERVV-1B6SEH8 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
ERVV-1B6SEH8 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
ERVV-1B6SEH8 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
ERVV-1B6SEH8 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
ERVV-1B6SEH8 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
ERVV-1B6SEH8 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
ERVV-1B6SEH8 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
ERVV-1B6SEH8 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
ERVV-1B6SEH8 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
ERVV-1B6SEH8 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
ERVV-1B6SEH8 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
ERVV-1B6SEH8 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
ERVV-1B6SEH8 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
ERVV-1B6SEH8 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
ERVV-1B6SEH8 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
ERVV-1B6SEH8 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
ERVV-1B6SEH8 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
ERVV-1B6SEH8 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC26.47■■□□□ 1.83
ERVV-1B6SEH8 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC26.47■■□□□ 1.83
ERVV-1B6SEH8 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
ERVV-1B6SEH8 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
ERVV-1B6SEH8 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
ERVV-1B6SEH8 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
ERVV-1B6SEH8 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
ERVV-1B6SEH8 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
ERVV-1B6SEH8 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
ERVV-1B6SEH8 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
ERVV-1B6SEH8 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
ERVV-1B6SEH8 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
ERVV-1B6SEH8 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
ERVV-1B6SEH8 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
ERVV-1B6SEH8 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
ERVV-1B6SEH8 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
ERVV-1B6SEH8 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
ERVV-1B6SEH8 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
ERVV-1B6SEH8 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
ERVV-1B6SEH8 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
ERVV-1B6SEH8 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
ERVV-1B6SEH8 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC26.46■■□□□ 1.83
ERVV-1B6SEH8 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
ERVV-1B6SEH8 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC26.45■■□□□ 1.83
ERVV-1B6SEH8 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
ERVV-1B6SEH8 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
ERVV-1B6SEH8 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
ERVV-1B6SEH8 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
ERVV-1B6SEH8 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
ERVV-1B6SEH8 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
ERVV-1B6SEH8 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
ERVV-1B6SEH8 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
ERVV-1B6SEH8 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
ERVV-1B6SEH8 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
ERVV-1B6SEH8 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
ERVV-1B6SEH8 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
ERVV-1B6SEH8 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
ERVV-1B6SEH8 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
ERVV-1B6SEH8 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
ERVV-1B6SEH8 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
ERVV-1B6SEH8 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
ERVV-1B6SEH8 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
ERVV-1B6SEH8 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
ERVV-1B6SEH8 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
ERVV-1B6SEH8 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
ERVV-1B6SEH8 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
ERVV-1B6SEH8 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
ERVV-1B6SEH8 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
ERVV-1B6SEH8 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
ERVV-1B6SEH8 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
ERVV-1B6SEH8 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
ERVV-1B6SEH8 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
ERVV-1B6SEH8 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
ERVV-1B6SEH8 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
ERVV-1B6SEH8 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
ERVV-1B6SEH8 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
ERVV-1B6SEH8 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
ERVV-1B6SEH8 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
ERVV-1B6SEH8 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
ERVV-1B6SEH8 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC26.43■■□□□ 1.82
ERVV-1B6SEH8 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
ERVV-1B6SEH8 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
ERVV-1B6SEH8 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
ERVV-1B6SEH8 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
ERVV-1B6SEH8 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
ERVV-1B6SEH8 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
ERVV-1B6SEH8 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
ERVV-1B6SEH8 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
ERVV-1B6SEH8 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
ERVV-1B6SEH8 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
ERVV-1B6SEH8 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
ERVV-1B6SEH8 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
ERVV-1B6SEH8 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
ERVV-1B6SEH8 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
ERVV-1B6SEH8 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
ERVV-1B6SEH8 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
ERVV-1B6SEH8 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
ERVV-1B6SEH8 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
ERVV-1B6SEH8 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
ERVV-1B6SEH8 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms