Protein–RNA interactions for Protein: B2RUZ4

SMIM1, Small integral membrane protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 78 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM1B2RUZ4 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
SMIM1B2RUZ4 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
SMIM1B2RUZ4 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
SMIM1B2RUZ4 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
SMIM1B2RUZ4 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
SMIM1B2RUZ4 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
SMIM1B2RUZ4 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC14.22□□□□□ -0.13
SMIM1B2RUZ4 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
SMIM1B2RUZ4 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
SMIM1B2RUZ4 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
SMIM1B2RUZ4 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
SMIM1B2RUZ4 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
SMIM1B2RUZ4 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
SMIM1B2RUZ4 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
SMIM1B2RUZ4 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
SMIM1B2RUZ4 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
SMIM1B2RUZ4 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
SMIM1B2RUZ4 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
SMIM1B2RUZ4 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
SMIM1B2RUZ4 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
SMIM1B2RUZ4 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
SMIM1B2RUZ4 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
SMIM1B2RUZ4 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
SMIM1B2RUZ4 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
SMIM1B2RUZ4 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
SMIM1B2RUZ4 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.21□□□□□ -0.13
SMIM1B2RUZ4 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
SMIM1B2RUZ4 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
SMIM1B2RUZ4 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
SMIM1B2RUZ4 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
SMIM1B2RUZ4 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
SMIM1B2RUZ4 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
SMIM1B2RUZ4 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
SMIM1B2RUZ4 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
SMIM1B2RUZ4 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.14
SMIM1B2RUZ4 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.14
SMIM1B2RUZ4 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
SMIM1B2RUZ4 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
SMIM1B2RUZ4 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
SMIM1B2RUZ4 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
SMIM1B2RUZ4 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
SMIM1B2RUZ4 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
SMIM1B2RUZ4 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
SMIM1B2RUZ4 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
SMIM1B2RUZ4 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
SMIM1B2RUZ4 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
SMIM1B2RUZ4 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
SMIM1B2RUZ4 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
SMIM1B2RUZ4 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
SMIM1B2RUZ4 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
SMIM1B2RUZ4 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
SMIM1B2RUZ4 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
SMIM1B2RUZ4 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
SMIM1B2RUZ4 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
SMIM1B2RUZ4 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
SMIM1B2RUZ4 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.2□□□□□ -0.14
SMIM1B2RUZ4 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
SMIM1B2RUZ4 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
SMIM1B2RUZ4 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
SMIM1B2RUZ4 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
SMIM1B2RUZ4 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
SMIM1B2RUZ4 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
SMIM1B2RUZ4 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
SMIM1B2RUZ4 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
SMIM1B2RUZ4 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
SMIM1B2RUZ4 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
SMIM1B2RUZ4 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
SMIM1B2RUZ4 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
SMIM1B2RUZ4 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
SMIM1B2RUZ4 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
SMIM1B2RUZ4 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
SMIM1B2RUZ4 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
SMIM1B2RUZ4 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
SMIM1B2RUZ4 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
SMIM1B2RUZ4 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
SMIM1B2RUZ4 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
SMIM1B2RUZ4 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
SMIM1B2RUZ4 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
SMIM1B2RUZ4 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
SMIM1B2RUZ4 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
SMIM1B2RUZ4 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
SMIM1B2RUZ4 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
SMIM1B2RUZ4 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
SMIM1B2RUZ4 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
SMIM1B2RUZ4 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
SMIM1B2RUZ4 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
SMIM1B2RUZ4 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
SMIM1B2RUZ4 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
SMIM1B2RUZ4 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
SMIM1B2RUZ4 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
SMIM1B2RUZ4 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
SMIM1B2RUZ4 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
SMIM1B2RUZ4 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
SMIM1B2RUZ4 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
SMIM1B2RUZ4 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
SMIM1B2RUZ4 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
SMIM1B2RUZ4 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
SMIM1B2RUZ4 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
SMIM1B2RUZ4 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
SMIM1B2RUZ4 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms