Protein–RNA interactions for Protein: B1ALY0

PALM2-AKAP2, PALM2-AKAP2 readthrough (Fragment), humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 433 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PALM2-AKAP2B1ALY0 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PALM2-AKAP2B1ALY0 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PALM2-AKAP2B1ALY0 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PALM2-AKAP2B1ALY0 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PALM2-AKAP2B1ALY0 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PALM2-AKAP2B1ALY0 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
PALM2-AKAP2B1ALY0 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PALM2-AKAP2B1ALY0 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PALM2-AKAP2B1ALY0 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PALM2-AKAP2B1ALY0 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PALM2-AKAP2B1ALY0 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
PALM2-AKAP2B1ALY0 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
PALM2-AKAP2B1ALY0 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
PALM2-AKAP2B1ALY0 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PALM2-AKAP2B1ALY0 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PALM2-AKAP2B1ALY0 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PALM2-AKAP2B1ALY0 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PALM2-AKAP2B1ALY0 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PALM2-AKAP2B1ALY0 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PALM2-AKAP2B1ALY0 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PALM2-AKAP2B1ALY0 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PALM2-AKAP2B1ALY0 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PALM2-AKAP2B1ALY0 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PALM2-AKAP2B1ALY0 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
PALM2-AKAP2B1ALY0 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
PALM2-AKAP2B1ALY0 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PALM2-AKAP2B1ALY0 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
PALM2-AKAP2B1ALY0 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PALM2-AKAP2B1ALY0 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PALM2-AKAP2B1ALY0 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PALM2-AKAP2B1ALY0 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PALM2-AKAP2B1ALY0 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PALM2-AKAP2B1ALY0 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PALM2-AKAP2B1ALY0 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PALM2-AKAP2B1ALY0 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PALM2-AKAP2B1ALY0 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PALM2-AKAP2B1ALY0 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PALM2-AKAP2B1ALY0 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PALM2-AKAP2B1ALY0 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PALM2-AKAP2B1ALY0 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PALM2-AKAP2B1ALY0 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PALM2-AKAP2B1ALY0 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PALM2-AKAP2B1ALY0 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PALM2-AKAP2B1ALY0 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PALM2-AKAP2B1ALY0 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PALM2-AKAP2B1ALY0 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PALM2-AKAP2B1ALY0 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PALM2-AKAP2B1ALY0 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PALM2-AKAP2B1ALY0 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PALM2-AKAP2B1ALY0 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
PALM2-AKAP2B1ALY0 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PALM2-AKAP2B1ALY0 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PALM2-AKAP2B1ALY0 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PALM2-AKAP2B1ALY0 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PALM2-AKAP2B1ALY0 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PALM2-AKAP2B1ALY0 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PALM2-AKAP2B1ALY0 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PALM2-AKAP2B1ALY0 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PALM2-AKAP2B1ALY0 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PALM2-AKAP2B1ALY0 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PALM2-AKAP2B1ALY0 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PALM2-AKAP2B1ALY0 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PALM2-AKAP2B1ALY0 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PALM2-AKAP2B1ALY0 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PALM2-AKAP2B1ALY0 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PALM2-AKAP2B1ALY0 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PALM2-AKAP2B1ALY0 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
PALM2-AKAP2B1ALY0 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PALM2-AKAP2B1ALY0 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
PALM2-AKAP2B1ALY0 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PALM2-AKAP2B1ALY0 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
PALM2-AKAP2B1ALY0 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PALM2-AKAP2B1ALY0 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PALM2-AKAP2B1ALY0 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PALM2-AKAP2B1ALY0 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PALM2-AKAP2B1ALY0 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PALM2-AKAP2B1ALY0 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PALM2-AKAP2B1ALY0 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PALM2-AKAP2B1ALY0 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PALM2-AKAP2B1ALY0 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PALM2-AKAP2B1ALY0 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PALM2-AKAP2B1ALY0 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PALM2-AKAP2B1ALY0 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PALM2-AKAP2B1ALY0 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PALM2-AKAP2B1ALY0 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PALM2-AKAP2B1ALY0 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PALM2-AKAP2B1ALY0 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PALM2-AKAP2B1ALY0 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PALM2-AKAP2B1ALY0 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PALM2-AKAP2B1ALY0 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PALM2-AKAP2B1ALY0 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PALM2-AKAP2B1ALY0 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PALM2-AKAP2B1ALY0 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PALM2-AKAP2B1ALY0 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PALM2-AKAP2B1ALY0 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PALM2-AKAP2B1ALY0 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PALM2-AKAP2B1ALY0 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PALM2-AKAP2B1ALY0 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PALM2-AKAP2B1ALY0 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PALM2-AKAP2B1ALY0 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms