Protein–RNA interactions for Protein: A6PVL3

KNCN, Kinocilin, humanhuman

Predictions only

Length 124 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KNCNA6PVL3 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
KNCNA6PVL3 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
KNCNA6PVL3 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
KNCNA6PVL3 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
KNCNA6PVL3 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
KNCNA6PVL3 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
KNCNA6PVL3 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
KNCNA6PVL3 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
KNCNA6PVL3 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
KNCNA6PVL3 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
KNCNA6PVL3 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
KNCNA6PVL3 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
KNCNA6PVL3 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC15.71■□□□□ 0.11
KNCNA6PVL3 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
KNCNA6PVL3 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
KNCNA6PVL3 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
KNCNA6PVL3 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
KNCNA6PVL3 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
KNCNA6PVL3 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
KNCNA6PVL3 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
KNCNA6PVL3 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
KNCNA6PVL3 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
KNCNA6PVL3 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
KNCNA6PVL3 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.1
KNCNA6PVL3 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
KNCNA6PVL3 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
KNCNA6PVL3 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
KNCNA6PVL3 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
KNCNA6PVL3 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
KNCNA6PVL3 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
KNCNA6PVL3 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
KNCNA6PVL3 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
KNCNA6PVL3 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
KNCNA6PVL3 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
KNCNA6PVL3 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
KNCNA6PVL3 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
KNCNA6PVL3 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
KNCNA6PVL3 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
KNCNA6PVL3 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
KNCNA6PVL3 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
KNCNA6PVL3 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
KNCNA6PVL3 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
KNCNA6PVL3 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
KNCNA6PVL3 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
KNCNA6PVL3 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
KNCNA6PVL3 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
KNCNA6PVL3 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
KNCNA6PVL3 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
KNCNA6PVL3 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
KNCNA6PVL3 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
KNCNA6PVL3 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
KNCNA6PVL3 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
KNCNA6PVL3 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
KNCNA6PVL3 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
KNCNA6PVL3 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
KNCNA6PVL3 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
KNCNA6PVL3 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
KNCNA6PVL3 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC15.69■□□□□ 0.1
KNCNA6PVL3 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
KNCNA6PVL3 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
KNCNA6PVL3 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
KNCNA6PVL3 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
KNCNA6PVL3 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
KNCNA6PVL3 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
KNCNA6PVL3 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
KNCNA6PVL3 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
KNCNA6PVL3 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
KNCNA6PVL3 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
KNCNA6PVL3 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
KNCNA6PVL3 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
KNCNA6PVL3 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
KNCNA6PVL3 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
KNCNA6PVL3 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
KNCNA6PVL3 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
KNCNA6PVL3 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
KNCNA6PVL3 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
KNCNA6PVL3 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
KNCNA6PVL3 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
KNCNA6PVL3 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
KNCNA6PVL3 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
KNCNA6PVL3 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
KNCNA6PVL3 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
KNCNA6PVL3 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
KNCNA6PVL3 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
KNCNA6PVL3 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
KNCNA6PVL3 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
KNCNA6PVL3 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
KNCNA6PVL3 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
KNCNA6PVL3 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
KNCNA6PVL3 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
KNCNA6PVL3 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
KNCNA6PVL3 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
KNCNA6PVL3 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
KNCNA6PVL3 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
KNCNA6PVL3 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
KNCNA6PVL3 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
KNCNA6PVL3 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
KNCNA6PVL3 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
KNCNA6PVL3 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
KNCNA6PVL3 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.2 ms