Protein–RNA interactions for Protein: A6NKP2

SDR42E2, Putative short-chain dehydrogenase/reductase family 42E member 2, humanhuman

Predictions only

Length 422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDR42E2A6NKP2 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SDR42E2A6NKP2 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SDR42E2A6NKP2 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SDR42E2A6NKP2 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SDR42E2A6NKP2 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC21.28■■□□□ 1
SDR42E2A6NKP2 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
SDR42E2A6NKP2 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SDR42E2A6NKP2 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC21.28■■□□□ 1
SDR42E2A6NKP2 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
SDR42E2A6NKP2 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
SDR42E2A6NKP2 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC21.28■■□□□ 1
SDR42E2A6NKP2 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SDR42E2A6NKP2 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SDR42E2A6NKP2 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC21.28■■□□□ 1
SDR42E2A6NKP2 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SDR42E2A6NKP2 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SDR42E2A6NKP2 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SDR42E2A6NKP2 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SDR42E2A6NKP2 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SDR42E2A6NKP2 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
SDR42E2A6NKP2 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SDR42E2A6NKP2 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SDR42E2A6NKP2 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SDR42E2A6NKP2 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SDR42E2A6NKP2 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SDR42E2A6NKP2 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SDR42E2A6NKP2 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SDR42E2A6NKP2 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SDR42E2A6NKP2 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
SDR42E2A6NKP2 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
SDR42E2A6NKP2 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SDR42E2A6NKP2 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SDR42E2A6NKP2 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SDR42E2A6NKP2 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SDR42E2A6NKP2 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SDR42E2A6NKP2 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SDR42E2A6NKP2 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SDR42E2A6NKP2 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SDR42E2A6NKP2 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SDR42E2A6NKP2 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SDR42E2A6NKP2 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SDR42E2A6NKP2 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
SDR42E2A6NKP2 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SDR42E2A6NKP2 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SDR42E2A6NKP2 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SDR42E2A6NKP2 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SDR42E2A6NKP2 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
SDR42E2A6NKP2 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SDR42E2A6NKP2 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SDR42E2A6NKP2 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SDR42E2A6NKP2 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SDR42E2A6NKP2 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SDR42E2A6NKP2 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SDR42E2A6NKP2 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SDR42E2A6NKP2 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SDR42E2A6NKP2 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SDR42E2A6NKP2 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SDR42E2A6NKP2 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SDR42E2A6NKP2 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SDR42E2A6NKP2 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SDR42E2A6NKP2 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SDR42E2A6NKP2 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
SDR42E2A6NKP2 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SDR42E2A6NKP2 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SDR42E2A6NKP2 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SDR42E2A6NKP2 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SDR42E2A6NKP2 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SDR42E2A6NKP2 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SDR42E2A6NKP2 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SDR42E2A6NKP2 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SDR42E2A6NKP2 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SDR42E2A6NKP2 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SDR42E2A6NKP2 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SDR42E2A6NKP2 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SDR42E2A6NKP2 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SDR42E2A6NKP2 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
SDR42E2A6NKP2 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SDR42E2A6NKP2 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SDR42E2A6NKP2 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SDR42E2A6NKP2 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SDR42E2A6NKP2 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SDR42E2A6NKP2 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SDR42E2A6NKP2 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SDR42E2A6NKP2 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SDR42E2A6NKP2 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SDR42E2A6NKP2 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SDR42E2A6NKP2 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SDR42E2A6NKP2 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SDR42E2A6NKP2 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
SDR42E2A6NKP2 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
SDR42E2A6NKP2 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SDR42E2A6NKP2 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SDR42E2A6NKP2 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SDR42E2A6NKP2 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SDR42E2A6NKP2 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SDR42E2A6NKP2 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SDR42E2A6NKP2 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SDR42E2A6NKP2 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SDR42E2A6NKP2 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SDR42E2A6NKP2 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms