Protein–RNA interactions for Protein: A6NI87

CBY3, Protein chibby homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 242 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBY3A6NI87 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CBY3A6NI87 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CBY3A6NI87 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
CBY3A6NI87 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
CBY3A6NI87 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
CBY3A6NI87 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
CBY3A6NI87 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CBY3A6NI87 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CBY3A6NI87 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CBY3A6NI87 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CBY3A6NI87 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CBY3A6NI87 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CBY3A6NI87 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CBY3A6NI87 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
CBY3A6NI87 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CBY3A6NI87 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CBY3A6NI87 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CBY3A6NI87 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CBY3A6NI87 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CBY3A6NI87 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CBY3A6NI87 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CBY3A6NI87 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CBY3A6NI87 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CBY3A6NI87 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CBY3A6NI87 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CBY3A6NI87 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CBY3A6NI87 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CBY3A6NI87 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CBY3A6NI87 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CBY3A6NI87 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
CBY3A6NI87 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CBY3A6NI87 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CBY3A6NI87 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
CBY3A6NI87 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
CBY3A6NI87 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CBY3A6NI87 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CBY3A6NI87 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CBY3A6NI87 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CBY3A6NI87 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CBY3A6NI87 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CBY3A6NI87 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CBY3A6NI87 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CBY3A6NI87 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CBY3A6NI87 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CBY3A6NI87 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CBY3A6NI87 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CBY3A6NI87 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CBY3A6NI87 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CBY3A6NI87 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CBY3A6NI87 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CBY3A6NI87 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CBY3A6NI87 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CBY3A6NI87 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CBY3A6NI87 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CBY3A6NI87 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CBY3A6NI87 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CBY3A6NI87 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CBY3A6NI87 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CBY3A6NI87 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CBY3A6NI87 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CBY3A6NI87 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CBY3A6NI87 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CBY3A6NI87 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CBY3A6NI87 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CBY3A6NI87 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CBY3A6NI87 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CBY3A6NI87 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CBY3A6NI87 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CBY3A6NI87 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CBY3A6NI87 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CBY3A6NI87 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CBY3A6NI87 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CBY3A6NI87 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CBY3A6NI87 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CBY3A6NI87 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CBY3A6NI87 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CBY3A6NI87 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CBY3A6NI87 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CBY3A6NI87 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CBY3A6NI87 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CBY3A6NI87 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CBY3A6NI87 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CBY3A6NI87 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CBY3A6NI87 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CBY3A6NI87 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CBY3A6NI87 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CBY3A6NI87 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CBY3A6NI87 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CBY3A6NI87 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CBY3A6NI87 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CBY3A6NI87 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CBY3A6NI87 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CBY3A6NI87 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CBY3A6NI87 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CBY3A6NI87 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CBY3A6NI87 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CBY3A6NI87 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CBY3A6NI87 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CBY3A6NI87 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CBY3A6NI87 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms