Protein–RNA interactions for Protein: A6NHQ4

EPOP, Elongin BC and Polycomb repressive complex 2-associated protein, humanhuman

Predictions only

Length 379 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPOPA6NHQ4 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
EPOPA6NHQ4 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
EPOPA6NHQ4 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
EPOPA6NHQ4 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
EPOPA6NHQ4 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
EPOPA6NHQ4 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
EPOPA6NHQ4 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
EPOPA6NHQ4 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
EPOPA6NHQ4 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
EPOPA6NHQ4 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
EPOPA6NHQ4 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
EPOPA6NHQ4 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
EPOPA6NHQ4 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
EPOPA6NHQ4 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
EPOPA6NHQ4 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
EPOPA6NHQ4 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
EPOPA6NHQ4 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
EPOPA6NHQ4 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
EPOPA6NHQ4 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
EPOPA6NHQ4 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
EPOPA6NHQ4 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
EPOPA6NHQ4 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
EPOPA6NHQ4 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
EPOPA6NHQ4 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
EPOPA6NHQ4 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
EPOPA6NHQ4 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
EPOPA6NHQ4 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
EPOPA6NHQ4 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
EPOPA6NHQ4 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
EPOPA6NHQ4 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
EPOPA6NHQ4 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
EPOPA6NHQ4 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
EPOPA6NHQ4 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
EPOPA6NHQ4 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
EPOPA6NHQ4 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
EPOPA6NHQ4 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
EPOPA6NHQ4 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
EPOPA6NHQ4 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
EPOPA6NHQ4 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
EPOPA6NHQ4 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
EPOPA6NHQ4 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
EPOPA6NHQ4 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
EPOPA6NHQ4 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
EPOPA6NHQ4 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
EPOPA6NHQ4 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
EPOPA6NHQ4 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
EPOPA6NHQ4 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
EPOPA6NHQ4 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
EPOPA6NHQ4 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
EPOPA6NHQ4 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
EPOPA6NHQ4 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
EPOPA6NHQ4 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
EPOPA6NHQ4 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
EPOPA6NHQ4 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
EPOPA6NHQ4 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
EPOPA6NHQ4 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
EPOPA6NHQ4 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
EPOPA6NHQ4 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
EPOPA6NHQ4 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
EPOPA6NHQ4 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
EPOPA6NHQ4 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
EPOPA6NHQ4 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
EPOPA6NHQ4 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
EPOPA6NHQ4 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
EPOPA6NHQ4 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
EPOPA6NHQ4 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
EPOPA6NHQ4 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
EPOPA6NHQ4 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
EPOPA6NHQ4 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
EPOPA6NHQ4 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
EPOPA6NHQ4 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
EPOPA6NHQ4 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
EPOPA6NHQ4 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
EPOPA6NHQ4 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
EPOPA6NHQ4 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
EPOPA6NHQ4 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
EPOPA6NHQ4 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
EPOPA6NHQ4 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
EPOPA6NHQ4 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
EPOPA6NHQ4 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
EPOPA6NHQ4 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
EPOPA6NHQ4 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
EPOPA6NHQ4 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
EPOPA6NHQ4 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
EPOPA6NHQ4 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
EPOPA6NHQ4 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
EPOPA6NHQ4 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
EPOPA6NHQ4 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
EPOPA6NHQ4 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
EPOPA6NHQ4 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
EPOPA6NHQ4 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
EPOPA6NHQ4 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
EPOPA6NHQ4 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
EPOPA6NHQ4 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
EPOPA6NHQ4 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
EPOPA6NHQ4 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
EPOPA6NHQ4 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
EPOPA6NHQ4 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
EPOPA6NHQ4 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
EPOPA6NHQ4 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms