Protein–RNA interactions for Protein: A6NDB9

PALM3, Paralemmin-3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 673 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PALM3A6NDB9 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PALM3A6NDB9 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PALM3A6NDB9 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PALM3A6NDB9 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
PALM3A6NDB9 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PALM3A6NDB9 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PALM3A6NDB9 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PALM3A6NDB9 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
PALM3A6NDB9 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PALM3A6NDB9 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PALM3A6NDB9 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
PALM3A6NDB9 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PALM3A6NDB9 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PALM3A6NDB9 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PALM3A6NDB9 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PALM3A6NDB9 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
PALM3A6NDB9 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
PALM3A6NDB9 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
PALM3A6NDB9 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
PALM3A6NDB9 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
PALM3A6NDB9 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
PALM3A6NDB9 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
PALM3A6NDB9 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PALM3A6NDB9 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PALM3A6NDB9 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PALM3A6NDB9 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
PALM3A6NDB9 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PALM3A6NDB9 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PALM3A6NDB9 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PALM3A6NDB9 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PALM3A6NDB9 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PALM3A6NDB9 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PALM3A6NDB9 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PALM3A6NDB9 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PALM3A6NDB9 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PALM3A6NDB9 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PALM3A6NDB9 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
PALM3A6NDB9 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PALM3A6NDB9 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PALM3A6NDB9 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PALM3A6NDB9 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PALM3A6NDB9 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PALM3A6NDB9 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PALM3A6NDB9 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PALM3A6NDB9 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PALM3A6NDB9 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PALM3A6NDB9 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PALM3A6NDB9 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PALM3A6NDB9 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PALM3A6NDB9 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PALM3A6NDB9 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PALM3A6NDB9 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PALM3A6NDB9 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PALM3A6NDB9 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PALM3A6NDB9 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PALM3A6NDB9 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PALM3A6NDB9 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PALM3A6NDB9 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PALM3A6NDB9 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PALM3A6NDB9 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PALM3A6NDB9 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PALM3A6NDB9 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PALM3A6NDB9 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PALM3A6NDB9 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PALM3A6NDB9 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PALM3A6NDB9 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PALM3A6NDB9 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
PALM3A6NDB9 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PALM3A6NDB9 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PALM3A6NDB9 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PALM3A6NDB9 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PALM3A6NDB9 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PALM3A6NDB9 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PALM3A6NDB9 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PALM3A6NDB9 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PALM3A6NDB9 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PALM3A6NDB9 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PALM3A6NDB9 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PALM3A6NDB9 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PALM3A6NDB9 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PALM3A6NDB9 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
PALM3A6NDB9 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PALM3A6NDB9 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PALM3A6NDB9 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PALM3A6NDB9 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PALM3A6NDB9 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PALM3A6NDB9 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PALM3A6NDB9 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
PALM3A6NDB9 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PALM3A6NDB9 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PALM3A6NDB9 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PALM3A6NDB9 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PALM3A6NDB9 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PALM3A6NDB9 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
PALM3A6NDB9 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PALM3A6NDB9 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PALM3A6NDB9 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PALM3A6NDB9 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PALM3A6NDB9 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PALM3A6NDB9 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms