Protein–RNA interactions for Protein: A4FU01

MTMR11, Myotubularin-related protein 11, humanhuman

Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTMR11A4FU01 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MTMR11A4FU01 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
MTMR11A4FU01 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MTMR11A4FU01 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
MTMR11A4FU01 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
MTMR11A4FU01 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
MTMR11A4FU01 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MTMR11A4FU01 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
MTMR11A4FU01 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
MTMR11A4FU01 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MTMR11A4FU01 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MTMR11A4FU01 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MTMR11A4FU01 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
MTMR11A4FU01 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MTMR11A4FU01 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
MTMR11A4FU01 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
MTMR11A4FU01 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
MTMR11A4FU01 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MTMR11A4FU01 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
MTMR11A4FU01 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
MTMR11A4FU01 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MTMR11A4FU01 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
MTMR11A4FU01 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
MTMR11A4FU01 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
MTMR11A4FU01 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MTMR11A4FU01 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MTMR11A4FU01 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MTMR11A4FU01 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
MTMR11A4FU01 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
MTMR11A4FU01 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
MTMR11A4FU01 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
MTMR11A4FU01 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
MTMR11A4FU01 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
MTMR11A4FU01 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
MTMR11A4FU01 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
MTMR11A4FU01 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
MTMR11A4FU01 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
MTMR11A4FU01 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
MTMR11A4FU01 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
MTMR11A4FU01 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
MTMR11A4FU01 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
MTMR11A4FU01 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
MTMR11A4FU01 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MTMR11A4FU01 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MTMR11A4FU01 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MTMR11A4FU01 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MTMR11A4FU01 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MTMR11A4FU01 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MTMR11A4FU01 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MTMR11A4FU01 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MTMR11A4FU01 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MTMR11A4FU01 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MTMR11A4FU01 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MTMR11A4FU01 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MTMR11A4FU01 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MTMR11A4FU01 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MTMR11A4FU01 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MTMR11A4FU01 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
MTMR11A4FU01 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MTMR11A4FU01 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MTMR11A4FU01 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MTMR11A4FU01 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
MTMR11A4FU01 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
MTMR11A4FU01 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
MTMR11A4FU01 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MTMR11A4FU01 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
MTMR11A4FU01 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MTMR11A4FU01 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MTMR11A4FU01 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MTMR11A4FU01 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MTMR11A4FU01 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MTMR11A4FU01 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MTMR11A4FU01 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MTMR11A4FU01 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MTMR11A4FU01 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
MTMR11A4FU01 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MTMR11A4FU01 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MTMR11A4FU01 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MTMR11A4FU01 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MTMR11A4FU01 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MTMR11A4FU01 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MTMR11A4FU01 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MTMR11A4FU01 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MTMR11A4FU01 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MTMR11A4FU01 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
MTMR11A4FU01 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MTMR11A4FU01 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MTMR11A4FU01 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
MTMR11A4FU01 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
MTMR11A4FU01 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
MTMR11A4FU01 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
MTMR11A4FU01 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MTMR11A4FU01 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
MTMR11A4FU01 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
MTMR11A4FU01 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MTMR11A4FU01 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MTMR11A4FU01 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MTMR11A4FU01 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MTMR11A4FU01 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MTMR11A4FU01 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms