Protein–RNA interactions for Protein: A4D1B5

GSAP, Gamma-secretase-activating protein, humanhuman

Predictions only

Length 854 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GSAPA4D1B5 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
GSAPA4D1B5 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
GSAPA4D1B5 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
GSAPA4D1B5 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
GSAPA4D1B5 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
GSAPA4D1B5 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
GSAPA4D1B5 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
GSAPA4D1B5 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
GSAPA4D1B5 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
GSAPA4D1B5 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
GSAPA4D1B5 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
GSAPA4D1B5 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
GSAPA4D1B5 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
GSAPA4D1B5 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
GSAPA4D1B5 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
GSAPA4D1B5 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
GSAPA4D1B5 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
GSAPA4D1B5 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
GSAPA4D1B5 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
GSAPA4D1B5 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
GSAPA4D1B5 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
GSAPA4D1B5 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
GSAPA4D1B5 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GSAPA4D1B5 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GSAPA4D1B5 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GSAPA4D1B5 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
GSAPA4D1B5 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GSAPA4D1B5 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
GSAPA4D1B5 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
GSAPA4D1B5 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GSAPA4D1B5 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
GSAPA4D1B5 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
GSAPA4D1B5 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
GSAPA4D1B5 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
GSAPA4D1B5 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
GSAPA4D1B5 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GSAPA4D1B5 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GSAPA4D1B5 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
GSAPA4D1B5 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GSAPA4D1B5 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
GSAPA4D1B5 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
GSAPA4D1B5 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
GSAPA4D1B5 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
GSAPA4D1B5 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
GSAPA4D1B5 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
GSAPA4D1B5 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
GSAPA4D1B5 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
GSAPA4D1B5 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
GSAPA4D1B5 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
GSAPA4D1B5 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
GSAPA4D1B5 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
GSAPA4D1B5 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
GSAPA4D1B5 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
GSAPA4D1B5 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC20.36■□□□□ 0.85
GSAPA4D1B5 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
GSAPA4D1B5 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
GSAPA4D1B5 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
GSAPA4D1B5 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
GSAPA4D1B5 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
GSAPA4D1B5 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
GSAPA4D1B5 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
GSAPA4D1B5 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
GSAPA4D1B5 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
GSAPA4D1B5 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
GSAPA4D1B5 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
GSAPA4D1B5 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
GSAPA4D1B5 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
GSAPA4D1B5 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
GSAPA4D1B5 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
GSAPA4D1B5 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
GSAPA4D1B5 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
GSAPA4D1B5 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
GSAPA4D1B5 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
GSAPA4D1B5 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC20.35■□□□□ 0.85
GSAPA4D1B5 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
GSAPA4D1B5 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
GSAPA4D1B5 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
GSAPA4D1B5 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
GSAPA4D1B5 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
GSAPA4D1B5 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
GSAPA4D1B5 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
GSAPA4D1B5 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
GSAPA4D1B5 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
GSAPA4D1B5 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
GSAPA4D1B5 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
GSAPA4D1B5 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
GSAPA4D1B5 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
GSAPA4D1B5 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
GSAPA4D1B5 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
GSAPA4D1B5 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
GSAPA4D1B5 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
GSAPA4D1B5 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
GSAPA4D1B5 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
GSAPA4D1B5 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
GSAPA4D1B5 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
GSAPA4D1B5 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
GSAPA4D1B5 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
GSAPA4D1B5 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
GSAPA4D1B5 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
GSAPA4D1B5 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 113.6 ms