Protein–RNA interactions for Protein: A1L4H1

SSC5D, Soluble scavenger receptor cysteine-rich domain-containing protein SSC5D, humanhuman

Predictions only

Length 1,573 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSC5DA1L4H1 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SSC5DA1L4H1 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SSC5DA1L4H1 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SSC5DA1L4H1 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SSC5DA1L4H1 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SSC5DA1L4H1 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SSC5DA1L4H1 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
SSC5DA1L4H1 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SSC5DA1L4H1 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SSC5DA1L4H1 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SSC5DA1L4H1 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SSC5DA1L4H1 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SSC5DA1L4H1 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SSC5DA1L4H1 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SSC5DA1L4H1 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SSC5DA1L4H1 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SSC5DA1L4H1 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SSC5DA1L4H1 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SSC5DA1L4H1 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SSC5DA1L4H1 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SSC5DA1L4H1 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SSC5DA1L4H1 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SSC5DA1L4H1 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SSC5DA1L4H1 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SSC5DA1L4H1 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SSC5DA1L4H1 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SSC5DA1L4H1 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SSC5DA1L4H1 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SSC5DA1L4H1 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SSC5DA1L4H1 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SSC5DA1L4H1 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SSC5DA1L4H1 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SSC5DA1L4H1 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SSC5DA1L4H1 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SSC5DA1L4H1 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SSC5DA1L4H1 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SSC5DA1L4H1 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
SSC5DA1L4H1 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SSC5DA1L4H1 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SSC5DA1L4H1 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SSC5DA1L4H1 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SSC5DA1L4H1 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SSC5DA1L4H1 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SSC5DA1L4H1 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SSC5DA1L4H1 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SSC5DA1L4H1 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SSC5DA1L4H1 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SSC5DA1L4H1 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SSC5DA1L4H1 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SSC5DA1L4H1 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SSC5DA1L4H1 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SSC5DA1L4H1 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
SSC5DA1L4H1 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SSC5DA1L4H1 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SSC5DA1L4H1 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SSC5DA1L4H1 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SSC5DA1L4H1 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SSC5DA1L4H1 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SSC5DA1L4H1 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SSC5DA1L4H1 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SSC5DA1L4H1 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
SSC5DA1L4H1 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SSC5DA1L4H1 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SSC5DA1L4H1 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SSC5DA1L4H1 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SSC5DA1L4H1 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SSC5DA1L4H1 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SSC5DA1L4H1 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SSC5DA1L4H1 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SSC5DA1L4H1 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SSC5DA1L4H1 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SSC5DA1L4H1 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SSC5DA1L4H1 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SSC5DA1L4H1 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SSC5DA1L4H1 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
SSC5DA1L4H1 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SSC5DA1L4H1 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SSC5DA1L4H1 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SSC5DA1L4H1 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SSC5DA1L4H1 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SSC5DA1L4H1 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SSC5DA1L4H1 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SSC5DA1L4H1 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SSC5DA1L4H1 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SSC5DA1L4H1 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SSC5DA1L4H1 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SSC5DA1L4H1 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SSC5DA1L4H1 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SSC5DA1L4H1 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SSC5DA1L4H1 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SSC5DA1L4H1 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SSC5DA1L4H1 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SSC5DA1L4H1 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SSC5DA1L4H1 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SSC5DA1L4H1 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SSC5DA1L4H1 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
SSC5DA1L4H1 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SSC5DA1L4H1 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
SSC5DA1L4H1 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SSC5DA1L4H1 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.9 ms