Protein–RNA interactions for Protein: A0A578

TCRBV5S1A1T, T-cell receptor beta variable 5-1 (Fragment), humanhuman

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Length 114 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCRBV5S1A1TA0A578 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
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TCRBV5S1A1TA0A578 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
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TCRBV5S1A1TA0A578 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
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TCRBV5S1A1TA0A578 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
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TCRBV5S1A1TA0A578 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TCRBV5S1A1TA0A578 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
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TCRBV5S1A1TA0A578 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TCRBV5S1A1TA0A578 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TCRBV5S1A1TA0A578 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TCRBV5S1A1TA0A578 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TCRBV5S1A1TA0A578 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
TCRBV5S1A1TA0A578 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TCRBV5S1A1TA0A578 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
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TCRBV5S1A1TA0A578 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
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TCRBV5S1A1TA0A578 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TCRBV5S1A1TA0A578 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
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TCRBV5S1A1TA0A578 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
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TCRBV5S1A1TA0A578 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
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TCRBV5S1A1TA0A578 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
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TCRBV5S1A1TA0A578 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TCRBV5S1A1TA0A578 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TCRBV5S1A1TA0A578 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TCRBV5S1A1TA0A578 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TCRBV5S1A1TA0A578 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TCRBV5S1A1TA0A578 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TCRBV5S1A1TA0A578 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
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TCRBV5S1A1TA0A578 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TCRBV5S1A1TA0A578 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
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TCRBV5S1A1TA0A578 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
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