Protein–RNA interactions for Protein: A0A1B0GVQ0

SPAAR, Small regulatory polypeptide of amino acid response, humanhuman

Predictions only

Length 90 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPAARA0A1B0GVQ0 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SPAARA0A1B0GVQ0 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SPAARA0A1B0GVQ0 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SPAARA0A1B0GVQ0 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SPAARA0A1B0GVQ0 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SPAARA0A1B0GVQ0 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SPAARA0A1B0GVQ0 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SPAARA0A1B0GVQ0 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SPAARA0A1B0GVQ0 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SPAARA0A1B0GVQ0 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SPAARA0A1B0GVQ0 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SPAARA0A1B0GVQ0 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SPAARA0A1B0GVQ0 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SPAARA0A1B0GVQ0 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SPAARA0A1B0GVQ0 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SPAARA0A1B0GVQ0 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
SPAARA0A1B0GVQ0 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SPAARA0A1B0GVQ0 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SPAARA0A1B0GVQ0 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SPAARA0A1B0GVQ0 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SPAARA0A1B0GVQ0 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SPAARA0A1B0GVQ0 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SPAARA0A1B0GVQ0 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SPAARA0A1B0GVQ0 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SPAARA0A1B0GVQ0 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SPAARA0A1B0GVQ0 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SPAARA0A1B0GVQ0 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SPAARA0A1B0GVQ0 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SPAARA0A1B0GVQ0 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SPAARA0A1B0GVQ0 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SPAARA0A1B0GVQ0 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
SPAARA0A1B0GVQ0 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SPAARA0A1B0GVQ0 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SPAARA0A1B0GVQ0 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SPAARA0A1B0GVQ0 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SPAARA0A1B0GVQ0 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SPAARA0A1B0GVQ0 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SPAARA0A1B0GVQ0 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SPAARA0A1B0GVQ0 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SPAARA0A1B0GVQ0 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SPAARA0A1B0GVQ0 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SPAARA0A1B0GVQ0 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SPAARA0A1B0GVQ0 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SPAARA0A1B0GVQ0 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
SPAARA0A1B0GVQ0 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SPAARA0A1B0GVQ0 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SPAARA0A1B0GVQ0 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SPAARA0A1B0GVQ0 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SPAARA0A1B0GVQ0 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SPAARA0A1B0GVQ0 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SPAARA0A1B0GVQ0 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SPAARA0A1B0GVQ0 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SPAARA0A1B0GVQ0 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SPAARA0A1B0GVQ0 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SPAARA0A1B0GVQ0 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SPAARA0A1B0GVQ0 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SPAARA0A1B0GVQ0 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SPAARA0A1B0GVQ0 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SPAARA0A1B0GVQ0 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SPAARA0A1B0GVQ0 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SPAARA0A1B0GVQ0 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SPAARA0A1B0GVQ0 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SPAARA0A1B0GVQ0 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SPAARA0A1B0GVQ0 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SPAARA0A1B0GVQ0 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SPAARA0A1B0GVQ0 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
SPAARA0A1B0GVQ0 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SPAARA0A1B0GVQ0 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SPAARA0A1B0GVQ0 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SPAARA0A1B0GVQ0 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SPAARA0A1B0GVQ0 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SPAARA0A1B0GVQ0 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SPAARA0A1B0GVQ0 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.83
SPAARA0A1B0GVQ0 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
SPAARA0A1B0GVQ0 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SPAARA0A1B0GVQ0 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SPAARA0A1B0GVQ0 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SPAARA0A1B0GVQ0 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SPAARA0A1B0GVQ0 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SPAARA0A1B0GVQ0 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SPAARA0A1B0GVQ0 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SPAARA0A1B0GVQ0 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SPAARA0A1B0GVQ0 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
SPAARA0A1B0GVQ0 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SPAARA0A1B0GVQ0 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SPAARA0A1B0GVQ0 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SPAARA0A1B0GVQ0 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SPAARA0A1B0GVQ0 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SPAARA0A1B0GVQ0 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
SPAARA0A1B0GVQ0 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SPAARA0A1B0GVQ0 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SPAARA0A1B0GVQ0 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SPAARA0A1B0GVQ0 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SPAARA0A1B0GVQ0 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SPAARA0A1B0GVQ0 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SPAARA0A1B0GVQ0 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SPAARA0A1B0GVQ0 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SPAARA0A1B0GVQ0 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SPAARA0A1B0GVQ0 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SPAARA0A1B0GVQ0 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.7 ms