Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6X2

PIAS3, E3 SUMO-protein ligase PIAS3, humanhuman

Predictions only

Length 628 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIAS3Q9Y6X2 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PIAS3Q9Y6X2 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PIAS3Q9Y6X2 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PIAS3Q9Y6X2 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PIAS3Q9Y6X2 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
PIAS3Q9Y6X2 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PIAS3Q9Y6X2 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PIAS3Q9Y6X2 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PIAS3Q9Y6X2 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PIAS3Q9Y6X2 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PIAS3Q9Y6X2 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PIAS3Q9Y6X2 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PIAS3Q9Y6X2 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PIAS3Q9Y6X2 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PIAS3Q9Y6X2 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PIAS3Q9Y6X2 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PIAS3Q9Y6X2 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PIAS3Q9Y6X2 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PIAS3Q9Y6X2 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PIAS3Q9Y6X2 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PIAS3Q9Y6X2 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PIAS3Q9Y6X2 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PIAS3Q9Y6X2 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PIAS3Q9Y6X2 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PIAS3Q9Y6X2 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PIAS3Q9Y6X2 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PIAS3Q9Y6X2 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PIAS3Q9Y6X2 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PIAS3Q9Y6X2 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PIAS3Q9Y6X2 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
PIAS3Q9Y6X2 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PIAS3Q9Y6X2 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PIAS3Q9Y6X2 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
PIAS3Q9Y6X2 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PIAS3Q9Y6X2 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PIAS3Q9Y6X2 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PIAS3Q9Y6X2 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PIAS3Q9Y6X2 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PIAS3Q9Y6X2 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PIAS3Q9Y6X2 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PIAS3Q9Y6X2 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PIAS3Q9Y6X2 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PIAS3Q9Y6X2 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PIAS3Q9Y6X2 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PIAS3Q9Y6X2 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PIAS3Q9Y6X2 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PIAS3Q9Y6X2 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PIAS3Q9Y6X2 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PIAS3Q9Y6X2 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PIAS3Q9Y6X2 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PIAS3Q9Y6X2 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PIAS3Q9Y6X2 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PIAS3Q9Y6X2 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PIAS3Q9Y6X2 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PIAS3Q9Y6X2 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PIAS3Q9Y6X2 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PIAS3Q9Y6X2 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PIAS3Q9Y6X2 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PIAS3Q9Y6X2 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PIAS3Q9Y6X2 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PIAS3Q9Y6X2 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PIAS3Q9Y6X2 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PIAS3Q9Y6X2 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PIAS3Q9Y6X2 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PIAS3Q9Y6X2 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
PIAS3Q9Y6X2 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PIAS3Q9Y6X2 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PIAS3Q9Y6X2 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
PIAS3Q9Y6X2 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PIAS3Q9Y6X2 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PIAS3Q9Y6X2 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PIAS3Q9Y6X2 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PIAS3Q9Y6X2 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PIAS3Q9Y6X2 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PIAS3Q9Y6X2 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PIAS3Q9Y6X2 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PIAS3Q9Y6X2 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PIAS3Q9Y6X2 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PIAS3Q9Y6X2 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PIAS3Q9Y6X2 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PIAS3Q9Y6X2 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PIAS3Q9Y6X2 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PIAS3Q9Y6X2 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PIAS3Q9Y6X2 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PIAS3Q9Y6X2 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PIAS3Q9Y6X2 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PIAS3Q9Y6X2 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PIAS3Q9Y6X2 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PIAS3Q9Y6X2 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PIAS3Q9Y6X2 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PIAS3Q9Y6X2 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PIAS3Q9Y6X2 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PIAS3Q9Y6X2 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
PIAS3Q9Y6X2 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PIAS3Q9Y6X2 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.03
PIAS3Q9Y6X2 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PIAS3Q9Y6X2 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PIAS3Q9Y6X2 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PIAS3Q9Y6X2 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PIAS3Q9Y6X2 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.9 ms