Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6H8

GJA3, Gap junction alpha-3 protein, humanhuman

Predictions only

Length 435 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJA3Q9Y6H8 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
GJA3Q9Y6H8 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
GJA3Q9Y6H8 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
GJA3Q9Y6H8 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
GJA3Q9Y6H8 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
GJA3Q9Y6H8 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
GJA3Q9Y6H8 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
GJA3Q9Y6H8 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
GJA3Q9Y6H8 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
GJA3Q9Y6H8 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
GJA3Q9Y6H8 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
GJA3Q9Y6H8 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
GJA3Q9Y6H8 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
GJA3Q9Y6H8 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
GJA3Q9Y6H8 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
GJA3Q9Y6H8 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
GJA3Q9Y6H8 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
GJA3Q9Y6H8 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
GJA3Q9Y6H8 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
GJA3Q9Y6H8 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
GJA3Q9Y6H8 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
GJA3Q9Y6H8 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
GJA3Q9Y6H8 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
GJA3Q9Y6H8 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
GJA3Q9Y6H8 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
GJA3Q9Y6H8 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
GJA3Q9Y6H8 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
GJA3Q9Y6H8 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
GJA3Q9Y6H8 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
GJA3Q9Y6H8 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
GJA3Q9Y6H8 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
GJA3Q9Y6H8 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
GJA3Q9Y6H8 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
GJA3Q9Y6H8 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
GJA3Q9Y6H8 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
GJA3Q9Y6H8 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
GJA3Q9Y6H8 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
GJA3Q9Y6H8 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
GJA3Q9Y6H8 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
GJA3Q9Y6H8 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
GJA3Q9Y6H8 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.5■■□□□ 1.67
GJA3Q9Y6H8 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
GJA3Q9Y6H8 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
GJA3Q9Y6H8 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
GJA3Q9Y6H8 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
GJA3Q9Y6H8 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
GJA3Q9Y6H8 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
GJA3Q9Y6H8 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
GJA3Q9Y6H8 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
GJA3Q9Y6H8 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
GJA3Q9Y6H8 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC25.49■■□□□ 1.67
GJA3Q9Y6H8 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
GJA3Q9Y6H8 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
GJA3Q9Y6H8 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
GJA3Q9Y6H8 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
GJA3Q9Y6H8 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
GJA3Q9Y6H8 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
GJA3Q9Y6H8 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
GJA3Q9Y6H8 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
GJA3Q9Y6H8 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
GJA3Q9Y6H8 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
GJA3Q9Y6H8 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC25.48■■□□□ 1.67
GJA3Q9Y6H8 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
GJA3Q9Y6H8 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
GJA3Q9Y6H8 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
GJA3Q9Y6H8 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
GJA3Q9Y6H8 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
GJA3Q9Y6H8 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
GJA3Q9Y6H8 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
GJA3Q9Y6H8 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
GJA3Q9Y6H8 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
GJA3Q9Y6H8 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
GJA3Q9Y6H8 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
GJA3Q9Y6H8 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
GJA3Q9Y6H8 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
GJA3Q9Y6H8 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
GJA3Q9Y6H8 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
GJA3Q9Y6H8 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
GJA3Q9Y6H8 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
GJA3Q9Y6H8 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
GJA3Q9Y6H8 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
GJA3Q9Y6H8 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
GJA3Q9Y6H8 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
GJA3Q9Y6H8 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
GJA3Q9Y6H8 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
GJA3Q9Y6H8 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
GJA3Q9Y6H8 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
GJA3Q9Y6H8 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
GJA3Q9Y6H8 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
GJA3Q9Y6H8 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
GJA3Q9Y6H8 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
GJA3Q9Y6H8 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.67
GJA3Q9Y6H8 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
GJA3Q9Y6H8 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
GJA3Q9Y6H8 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
GJA3Q9Y6H8 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
GJA3Q9Y6H8 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
GJA3Q9Y6H8 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
GJA3Q9Y6H8 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
GJA3Q9Y6H8 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.5 ms