Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6G3

MRPL42, 39S ribosomal protein L42, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRPL42Q9Y6G3 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MRPL42Q9Y6G3 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MRPL42Q9Y6G3 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MRPL42Q9Y6G3 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MRPL42Q9Y6G3 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
MRPL42Q9Y6G3 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
MRPL42Q9Y6G3 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MRPL42Q9Y6G3 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MRPL42Q9Y6G3 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MRPL42Q9Y6G3 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MRPL42Q9Y6G3 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MRPL42Q9Y6G3 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MRPL42Q9Y6G3 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MRPL42Q9Y6G3 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MRPL42Q9Y6G3 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MRPL42Q9Y6G3 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MRPL42Q9Y6G3 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MRPL42Q9Y6G3 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
MRPL42Q9Y6G3 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
MRPL42Q9Y6G3 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MRPL42Q9Y6G3 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
MRPL42Q9Y6G3 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
MRPL42Q9Y6G3 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MRPL42Q9Y6G3 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
MRPL42Q9Y6G3 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
MRPL42Q9Y6G3 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
MRPL42Q9Y6G3 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
MRPL42Q9Y6G3 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
MRPL42Q9Y6G3 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MRPL42Q9Y6G3 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
MRPL42Q9Y6G3 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
MRPL42Q9Y6G3 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MRPL42Q9Y6G3 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
MRPL42Q9Y6G3 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MRPL42Q9Y6G3 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
MRPL42Q9Y6G3 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MRPL42Q9Y6G3 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MRPL42Q9Y6G3 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MRPL42Q9Y6G3 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MRPL42Q9Y6G3 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MRPL42Q9Y6G3 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MRPL42Q9Y6G3 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MRPL42Q9Y6G3 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MRPL42Q9Y6G3 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MRPL42Q9Y6G3 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MRPL42Q9Y6G3 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
MRPL42Q9Y6G3 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MRPL42Q9Y6G3 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MRPL42Q9Y6G3 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MRPL42Q9Y6G3 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MRPL42Q9Y6G3 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MRPL42Q9Y6G3 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MRPL42Q9Y6G3 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MRPL42Q9Y6G3 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MRPL42Q9Y6G3 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
MRPL42Q9Y6G3 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MRPL42Q9Y6G3 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MRPL42Q9Y6G3 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
MRPL42Q9Y6G3 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MRPL42Q9Y6G3 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MRPL42Q9Y6G3 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
MRPL42Q9Y6G3 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
MRPL42Q9Y6G3 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
MRPL42Q9Y6G3 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
MRPL42Q9Y6G3 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
MRPL42Q9Y6G3 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
MRPL42Q9Y6G3 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
MRPL42Q9Y6G3 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MRPL42Q9Y6G3 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MRPL42Q9Y6G3 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
MRPL42Q9Y6G3 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MRPL42Q9Y6G3 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MRPL42Q9Y6G3 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
MRPL42Q9Y6G3 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
MRPL42Q9Y6G3 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MRPL42Q9Y6G3 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
MRPL42Q9Y6G3 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MRPL42Q9Y6G3 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
MRPL42Q9Y6G3 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MRPL42Q9Y6G3 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
MRPL42Q9Y6G3 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
MRPL42Q9Y6G3 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
MRPL42Q9Y6G3 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
MRPL42Q9Y6G3 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MRPL42Q9Y6G3 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
MRPL42Q9Y6G3 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
MRPL42Q9Y6G3 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
MRPL42Q9Y6G3 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
MRPL42Q9Y6G3 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
MRPL42Q9Y6G3 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MRPL42Q9Y6G3 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MRPL42Q9Y6G3 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
MRPL42Q9Y6G3 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MRPL42Q9Y6G3 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
MRPL42Q9Y6G3 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MRPL42Q9Y6G3 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
MRPL42Q9Y6G3 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
MRPL42Q9Y6G3 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
MRPL42Q9Y6G3 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
MRPL42Q9Y6G3 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.7 ms