Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5R8

TRAPPC1, Trafficking protein particle complex subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC1Q9Y5R8 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TRAPPC1Q9Y5R8 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TRAPPC1Q9Y5R8 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TRAPPC1Q9Y5R8 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TRAPPC1Q9Y5R8 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TRAPPC1Q9Y5R8 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRAPPC1Q9Y5R8 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRAPPC1Q9Y5R8 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRAPPC1Q9Y5R8 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRAPPC1Q9Y5R8 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRAPPC1Q9Y5R8 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRAPPC1Q9Y5R8 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRAPPC1Q9Y5R8 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRAPPC1Q9Y5R8 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRAPPC1Q9Y5R8 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRAPPC1Q9Y5R8 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRAPPC1Q9Y5R8 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRAPPC1Q9Y5R8 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRAPPC1Q9Y5R8 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRAPPC1Q9Y5R8 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRAPPC1Q9Y5R8 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRAPPC1Q9Y5R8 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRAPPC1Q9Y5R8 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRAPPC1Q9Y5R8 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRAPPC1Q9Y5R8 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRAPPC1Q9Y5R8 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRAPPC1Q9Y5R8 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRAPPC1Q9Y5R8 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRAPPC1Q9Y5R8 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRAPPC1Q9Y5R8 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRAPPC1Q9Y5R8 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRAPPC1Q9Y5R8 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRAPPC1Q9Y5R8 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRAPPC1Q9Y5R8 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRAPPC1Q9Y5R8 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRAPPC1Q9Y5R8 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRAPPC1Q9Y5R8 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRAPPC1Q9Y5R8 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRAPPC1Q9Y5R8 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRAPPC1Q9Y5R8 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRAPPC1Q9Y5R8 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRAPPC1Q9Y5R8 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRAPPC1Q9Y5R8 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRAPPC1Q9Y5R8 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRAPPC1Q9Y5R8 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRAPPC1Q9Y5R8 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRAPPC1Q9Y5R8 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRAPPC1Q9Y5R8 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRAPPC1Q9Y5R8 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRAPPC1Q9Y5R8 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRAPPC1Q9Y5R8 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRAPPC1Q9Y5R8 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRAPPC1Q9Y5R8 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRAPPC1Q9Y5R8 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRAPPC1Q9Y5R8 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRAPPC1Q9Y5R8 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRAPPC1Q9Y5R8 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRAPPC1Q9Y5R8 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRAPPC1Q9Y5R8 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRAPPC1Q9Y5R8 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRAPPC1Q9Y5R8 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRAPPC1Q9Y5R8 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRAPPC1Q9Y5R8 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRAPPC1Q9Y5R8 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRAPPC1Q9Y5R8 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRAPPC1Q9Y5R8 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRAPPC1Q9Y5R8 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRAPPC1Q9Y5R8 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
TRAPPC1Q9Y5R8 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRAPPC1Q9Y5R8 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRAPPC1Q9Y5R8 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRAPPC1Q9Y5R8 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRAPPC1Q9Y5R8 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRAPPC1Q9Y5R8 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
TRAPPC1Q9Y5R8 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRAPPC1Q9Y5R8 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRAPPC1Q9Y5R8 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRAPPC1Q9Y5R8 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRAPPC1Q9Y5R8 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRAPPC1Q9Y5R8 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRAPPC1Q9Y5R8 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRAPPC1Q9Y5R8 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRAPPC1Q9Y5R8 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRAPPC1Q9Y5R8 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRAPPC1Q9Y5R8 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRAPPC1Q9Y5R8 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRAPPC1Q9Y5R8 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRAPPC1Q9Y5R8 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRAPPC1Q9Y5R8 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRAPPC1Q9Y5R8 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRAPPC1Q9Y5R8 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRAPPC1Q9Y5R8 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRAPPC1Q9Y5R8 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRAPPC1Q9Y5R8 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
TRAPPC1Q9Y5R8 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRAPPC1Q9Y5R8 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRAPPC1Q9Y5R8 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRAPPC1Q9Y5R8 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRAPPC1Q9Y5R8 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRAPPC1Q9Y5R8 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms