Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5J5

PHLDA3, Pleckstrin homology-like domain family A member 3, humanhuman

Predictions only

Length 127 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHLDA3Q9Y5J5 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PHLDA3Q9Y5J5 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PHLDA3Q9Y5J5 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
PHLDA3Q9Y5J5 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PHLDA3Q9Y5J5 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PHLDA3Q9Y5J5 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PHLDA3Q9Y5J5 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PHLDA3Q9Y5J5 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PHLDA3Q9Y5J5 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PHLDA3Q9Y5J5 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PHLDA3Q9Y5J5 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PHLDA3Q9Y5J5 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PHLDA3Q9Y5J5 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PHLDA3Q9Y5J5 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PHLDA3Q9Y5J5 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PHLDA3Q9Y5J5 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PHLDA3Q9Y5J5 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PHLDA3Q9Y5J5 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
PHLDA3Q9Y5J5 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PHLDA3Q9Y5J5 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PHLDA3Q9Y5J5 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PHLDA3Q9Y5J5 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PHLDA3Q9Y5J5 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PHLDA3Q9Y5J5 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PHLDA3Q9Y5J5 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
PHLDA3Q9Y5J5 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PHLDA3Q9Y5J5 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PHLDA3Q9Y5J5 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
PHLDA3Q9Y5J5 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PHLDA3Q9Y5J5 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PHLDA3Q9Y5J5 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PHLDA3Q9Y5J5 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PHLDA3Q9Y5J5 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PHLDA3Q9Y5J5 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PHLDA3Q9Y5J5 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PHLDA3Q9Y5J5 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PHLDA3Q9Y5J5 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PHLDA3Q9Y5J5 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PHLDA3Q9Y5J5 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PHLDA3Q9Y5J5 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PHLDA3Q9Y5J5 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PHLDA3Q9Y5J5 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PHLDA3Q9Y5J5 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
PHLDA3Q9Y5J5 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PHLDA3Q9Y5J5 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PHLDA3Q9Y5J5 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
PHLDA3Q9Y5J5 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PHLDA3Q9Y5J5 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PHLDA3Q9Y5J5 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
PHLDA3Q9Y5J5 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PHLDA3Q9Y5J5 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PHLDA3Q9Y5J5 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PHLDA3Q9Y5J5 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PHLDA3Q9Y5J5 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PHLDA3Q9Y5J5 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.07
PHLDA3Q9Y5J5 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PHLDA3Q9Y5J5 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
PHLDA3Q9Y5J5 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
PHLDA3Q9Y5J5 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
PHLDA3Q9Y5J5 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PHLDA3Q9Y5J5 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PHLDA3Q9Y5J5 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PHLDA3Q9Y5J5 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PHLDA3Q9Y5J5 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PHLDA3Q9Y5J5 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PHLDA3Q9Y5J5 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PHLDA3Q9Y5J5 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PHLDA3Q9Y5J5 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PHLDA3Q9Y5J5 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PHLDA3Q9Y5J5 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PHLDA3Q9Y5J5 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PHLDA3Q9Y5J5 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PHLDA3Q9Y5J5 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PHLDA3Q9Y5J5 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PHLDA3Q9Y5J5 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PHLDA3Q9Y5J5 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PHLDA3Q9Y5J5 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PHLDA3Q9Y5J5 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PHLDA3Q9Y5J5 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PHLDA3Q9Y5J5 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PHLDA3Q9Y5J5 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PHLDA3Q9Y5J5 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PHLDA3Q9Y5J5 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PHLDA3Q9Y5J5 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PHLDA3Q9Y5J5 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PHLDA3Q9Y5J5 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PHLDA3Q9Y5J5 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PHLDA3Q9Y5J5 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PHLDA3Q9Y5J5 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PHLDA3Q9Y5J5 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PHLDA3Q9Y5J5 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PHLDA3Q9Y5J5 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PHLDA3Q9Y5J5 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PHLDA3Q9Y5J5 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
PHLDA3Q9Y5J5 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
PHLDA3Q9Y5J5 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
PHLDA3Q9Y5J5 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
PHLDA3Q9Y5J5 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PHLDA3Q9Y5J5 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PHLDA3Q9Y5J5 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms