Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y561

LRP12, Low-density lipoprotein receptor-related protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 859 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRP12Q9Y561 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
LRP12Q9Y561 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
LRP12Q9Y561 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
LRP12Q9Y561 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
LRP12Q9Y561 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
LRP12Q9Y561 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
LRP12Q9Y561 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
LRP12Q9Y561 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
LRP12Q9Y561 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
LRP12Q9Y561 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.51■□□□□ 0.55
LRP12Q9Y561 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
LRP12Q9Y561 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
LRP12Q9Y561 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
LRP12Q9Y561 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
LRP12Q9Y561 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
LRP12Q9Y561 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
LRP12Q9Y561 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
LRP12Q9Y561 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
LRP12Q9Y561 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
LRP12Q9Y561 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
LRP12Q9Y561 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
LRP12Q9Y561 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
LRP12Q9Y561 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
LRP12Q9Y561 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
LRP12Q9Y561 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
LRP12Q9Y561 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
LRP12Q9Y561 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
LRP12Q9Y561 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
LRP12Q9Y561 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
LRP12Q9Y561 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
LRP12Q9Y561 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
LRP12Q9Y561 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LRP12Q9Y561 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
LRP12Q9Y561 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LRP12Q9Y561 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LRP12Q9Y561 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LRP12Q9Y561 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LRP12Q9Y561 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
LRP12Q9Y561 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LRP12Q9Y561 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
LRP12Q9Y561 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LRP12Q9Y561 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
LRP12Q9Y561 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LRP12Q9Y561 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LRP12Q9Y561 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LRP12Q9Y561 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
LRP12Q9Y561 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
LRP12Q9Y561 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
LRP12Q9Y561 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
LRP12Q9Y561 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
LRP12Q9Y561 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
LRP12Q9Y561 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
LRP12Q9Y561 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
LRP12Q9Y561 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
LRP12Q9Y561 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
LRP12Q9Y561 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
LRP12Q9Y561 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
LRP12Q9Y561 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
LRP12Q9Y561 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
LRP12Q9Y561 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
LRP12Q9Y561 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
LRP12Q9Y561 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
LRP12Q9Y561 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
LRP12Q9Y561 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
LRP12Q9Y561 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
LRP12Q9Y561 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
LRP12Q9Y561 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
LRP12Q9Y561 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
LRP12Q9Y561 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
LRP12Q9Y561 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC18.47■□□□□ 0.55
LRP12Q9Y561 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.47■□□□□ 0.55
LRP12Q9Y561 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
LRP12Q9Y561 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
LRP12Q9Y561 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
LRP12Q9Y561 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LRP12Q9Y561 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
LRP12Q9Y561 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
LRP12Q9Y561 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
LRP12Q9Y561 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
LRP12Q9Y561 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LRP12Q9Y561 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LRP12Q9Y561 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LRP12Q9Y561 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
LRP12Q9Y561 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
LRP12Q9Y561 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
LRP12Q9Y561 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
LRP12Q9Y561 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
LRP12Q9Y561 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
LRP12Q9Y561 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
LRP12Q9Y561 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
LRP12Q9Y561 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
LRP12Q9Y561 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
LRP12Q9Y561 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
LRP12Q9Y561 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
LRP12Q9Y561 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
LRP12Q9Y561 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
LRP12Q9Y561 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LRP12Q9Y561 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LRP12Q9Y561 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
LRP12Q9Y561 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.8 ms