Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2U8

LEMD3, Inner nuclear membrane protein Man1, humanhuman

Predictions only

Length 911 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LEMD3Q9Y2U8 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
LEMD3Q9Y2U8 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
LEMD3Q9Y2U8 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
LEMD3Q9Y2U8 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
LEMD3Q9Y2U8 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
LEMD3Q9Y2U8 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
LEMD3Q9Y2U8 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
LEMD3Q9Y2U8 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
LEMD3Q9Y2U8 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC25.76■■□□□ 1.71
LEMD3Q9Y2U8 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
LEMD3Q9Y2U8 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
LEMD3Q9Y2U8 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
LEMD3Q9Y2U8 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
LEMD3Q9Y2U8 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
LEMD3Q9Y2U8 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
LEMD3Q9Y2U8 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
LEMD3Q9Y2U8 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
LEMD3Q9Y2U8 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
LEMD3Q9Y2U8 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
LEMD3Q9Y2U8 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
LEMD3Q9Y2U8 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
LEMD3Q9Y2U8 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
LEMD3Q9Y2U8 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
LEMD3Q9Y2U8 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
LEMD3Q9Y2U8 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC25.74■■□□□ 1.71
LEMD3Q9Y2U8 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
LEMD3Q9Y2U8 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
LEMD3Q9Y2U8 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
LEMD3Q9Y2U8 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
LEMD3Q9Y2U8 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
LEMD3Q9Y2U8 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
LEMD3Q9Y2U8 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
LEMD3Q9Y2U8 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
LEMD3Q9Y2U8 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
LEMD3Q9Y2U8 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
LEMD3Q9Y2U8 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
LEMD3Q9Y2U8 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
LEMD3Q9Y2U8 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
LEMD3Q9Y2U8 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
LEMD3Q9Y2U8 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
LEMD3Q9Y2U8 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
LEMD3Q9Y2U8 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
LEMD3Q9Y2U8 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
LEMD3Q9Y2U8 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
LEMD3Q9Y2U8 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
LEMD3Q9Y2U8 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
LEMD3Q9Y2U8 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
LEMD3Q9Y2U8 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
LEMD3Q9Y2U8 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
LEMD3Q9Y2U8 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
LEMD3Q9Y2U8 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC25.72■■□□□ 1.71
LEMD3Q9Y2U8 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
LEMD3Q9Y2U8 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
LEMD3Q9Y2U8 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
LEMD3Q9Y2U8 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
LEMD3Q9Y2U8 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
LEMD3Q9Y2U8 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
LEMD3Q9Y2U8 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
LEMD3Q9Y2U8 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
LEMD3Q9Y2U8 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
LEMD3Q9Y2U8 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
LEMD3Q9Y2U8 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
LEMD3Q9Y2U8 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
LEMD3Q9Y2U8 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
LEMD3Q9Y2U8 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
LEMD3Q9Y2U8 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
LEMD3Q9Y2U8 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
LEMD3Q9Y2U8 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
LEMD3Q9Y2U8 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
LEMD3Q9Y2U8 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
LEMD3Q9Y2U8 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
LEMD3Q9Y2U8 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
LEMD3Q9Y2U8 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
LEMD3Q9Y2U8 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
LEMD3Q9Y2U8 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
LEMD3Q9Y2U8 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
LEMD3Q9Y2U8 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
LEMD3Q9Y2U8 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
LEMD3Q9Y2U8 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
LEMD3Q9Y2U8 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
LEMD3Q9Y2U8 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
LEMD3Q9Y2U8 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
LEMD3Q9Y2U8 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
LEMD3Q9Y2U8 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
LEMD3Q9Y2U8 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
LEMD3Q9Y2U8 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
LEMD3Q9Y2U8 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
LEMD3Q9Y2U8 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
LEMD3Q9Y2U8 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
LEMD3Q9Y2U8 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
LEMD3Q9Y2U8 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
LEMD3Q9Y2U8 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
LEMD3Q9Y2U8 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
LEMD3Q9Y2U8 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
LEMD3Q9Y2U8 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
LEMD3Q9Y2U8 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
LEMD3Q9Y2U8 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
LEMD3Q9Y2U8 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
LEMD3Q9Y2U8 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
LEMD3Q9Y2U8 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms