Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2D8

SSX2IP, Afadin- and alpha-actinin-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 614 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSX2IPQ9Y2D8 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SSX2IPQ9Y2D8 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SSX2IPQ9Y2D8 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SSX2IPQ9Y2D8 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SSX2IPQ9Y2D8 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SSX2IPQ9Y2D8 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SSX2IPQ9Y2D8 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SSX2IPQ9Y2D8 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SSX2IPQ9Y2D8 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
SSX2IPQ9Y2D8 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SSX2IPQ9Y2D8 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SSX2IPQ9Y2D8 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
SSX2IPQ9Y2D8 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SSX2IPQ9Y2D8 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SSX2IPQ9Y2D8 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SSX2IPQ9Y2D8 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SSX2IPQ9Y2D8 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SSX2IPQ9Y2D8 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SSX2IPQ9Y2D8 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SSX2IPQ9Y2D8 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SSX2IPQ9Y2D8 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SSX2IPQ9Y2D8 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SSX2IPQ9Y2D8 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SSX2IPQ9Y2D8 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SSX2IPQ9Y2D8 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SSX2IPQ9Y2D8 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SSX2IPQ9Y2D8 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
SSX2IPQ9Y2D8 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SSX2IPQ9Y2D8 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SSX2IPQ9Y2D8 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SSX2IPQ9Y2D8 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SSX2IPQ9Y2D8 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SSX2IPQ9Y2D8 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SSX2IPQ9Y2D8 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SSX2IPQ9Y2D8 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SSX2IPQ9Y2D8 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SSX2IPQ9Y2D8 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SSX2IPQ9Y2D8 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SSX2IPQ9Y2D8 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SSX2IPQ9Y2D8 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SSX2IPQ9Y2D8 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SSX2IPQ9Y2D8 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SSX2IPQ9Y2D8 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SSX2IPQ9Y2D8 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SSX2IPQ9Y2D8 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SSX2IPQ9Y2D8 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SSX2IPQ9Y2D8 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SSX2IPQ9Y2D8 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SSX2IPQ9Y2D8 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SSX2IPQ9Y2D8 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SSX2IPQ9Y2D8 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SSX2IPQ9Y2D8 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SSX2IPQ9Y2D8 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SSX2IPQ9Y2D8 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SSX2IPQ9Y2D8 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SSX2IPQ9Y2D8 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SSX2IPQ9Y2D8 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
SSX2IPQ9Y2D8 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SSX2IPQ9Y2D8 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SSX2IPQ9Y2D8 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SSX2IPQ9Y2D8 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SSX2IPQ9Y2D8 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SSX2IPQ9Y2D8 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SSX2IPQ9Y2D8 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SSX2IPQ9Y2D8 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SSX2IPQ9Y2D8 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
SSX2IPQ9Y2D8 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SSX2IPQ9Y2D8 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SSX2IPQ9Y2D8 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SSX2IPQ9Y2D8 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SSX2IPQ9Y2D8 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SSX2IPQ9Y2D8 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SSX2IPQ9Y2D8 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SSX2IPQ9Y2D8 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SSX2IPQ9Y2D8 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SSX2IPQ9Y2D8 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SSX2IPQ9Y2D8 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SSX2IPQ9Y2D8 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SSX2IPQ9Y2D8 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SSX2IPQ9Y2D8 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SSX2IPQ9Y2D8 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SSX2IPQ9Y2D8 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SSX2IPQ9Y2D8 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SSX2IPQ9Y2D8 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
SSX2IPQ9Y2D8 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
SSX2IPQ9Y2D8 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SSX2IPQ9Y2D8 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SSX2IPQ9Y2D8 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SSX2IPQ9Y2D8 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
SSX2IPQ9Y2D8 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
SSX2IPQ9Y2D8 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
SSX2IPQ9Y2D8 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SSX2IPQ9Y2D8 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SSX2IPQ9Y2D8 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SSX2IPQ9Y2D8 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
SSX2IPQ9Y2D8 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SSX2IPQ9Y2D8 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SSX2IPQ9Y2D8 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SSX2IPQ9Y2D8 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SSX2IPQ9Y2D8 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms