Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPZ3

HPS5, Hermansky-Pudlak syndrome 5 protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPS5Q9UPZ3 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
HPS5Q9UPZ3 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
HPS5Q9UPZ3 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
HPS5Q9UPZ3 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
HPS5Q9UPZ3 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
HPS5Q9UPZ3 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
HPS5Q9UPZ3 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
HPS5Q9UPZ3 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
HPS5Q9UPZ3 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC25.24■■□□□ 1.63
HPS5Q9UPZ3 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
HPS5Q9UPZ3 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
HPS5Q9UPZ3 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
HPS5Q9UPZ3 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
HPS5Q9UPZ3 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
HPS5Q9UPZ3 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
HPS5Q9UPZ3 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
HPS5Q9UPZ3 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
HPS5Q9UPZ3 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
HPS5Q9UPZ3 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
HPS5Q9UPZ3 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
HPS5Q9UPZ3 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
HPS5Q9UPZ3 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
HPS5Q9UPZ3 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
HPS5Q9UPZ3 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
HPS5Q9UPZ3 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
HPS5Q9UPZ3 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
HPS5Q9UPZ3 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
HPS5Q9UPZ3 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
HPS5Q9UPZ3 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
HPS5Q9UPZ3 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
HPS5Q9UPZ3 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
HPS5Q9UPZ3 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
HPS5Q9UPZ3 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
HPS5Q9UPZ3 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
HPS5Q9UPZ3 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
HPS5Q9UPZ3 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC25.22■■□□□ 1.63
HPS5Q9UPZ3 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
HPS5Q9UPZ3 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
HPS5Q9UPZ3 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
HPS5Q9UPZ3 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
HPS5Q9UPZ3 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
HPS5Q9UPZ3 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
HPS5Q9UPZ3 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
HPS5Q9UPZ3 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
HPS5Q9UPZ3 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
HPS5Q9UPZ3 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
HPS5Q9UPZ3 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC25.21■■□□□ 1.63
HPS5Q9UPZ3 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
HPS5Q9UPZ3 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
HPS5Q9UPZ3 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
HPS5Q9UPZ3 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
HPS5Q9UPZ3 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
HPS5Q9UPZ3 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
HPS5Q9UPZ3 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
HPS5Q9UPZ3 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
HPS5Q9UPZ3 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
HPS5Q9UPZ3 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
HPS5Q9UPZ3 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
HPS5Q9UPZ3 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
HPS5Q9UPZ3 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
HPS5Q9UPZ3 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
HPS5Q9UPZ3 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
HPS5Q9UPZ3 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
HPS5Q9UPZ3 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
HPS5Q9UPZ3 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
HPS5Q9UPZ3 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
HPS5Q9UPZ3 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
HPS5Q9UPZ3 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
HPS5Q9UPZ3 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
HPS5Q9UPZ3 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
HPS5Q9UPZ3 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
HPS5Q9UPZ3 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
HPS5Q9UPZ3 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
HPS5Q9UPZ3 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
HPS5Q9UPZ3 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
HPS5Q9UPZ3 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
HPS5Q9UPZ3 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
HPS5Q9UPZ3 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
HPS5Q9UPZ3 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
HPS5Q9UPZ3 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
HPS5Q9UPZ3 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
HPS5Q9UPZ3 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
HPS5Q9UPZ3 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
HPS5Q9UPZ3 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
HPS5Q9UPZ3 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
HPS5Q9UPZ3 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
HPS5Q9UPZ3 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
HPS5Q9UPZ3 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC25.17■■□□□ 1.62
HPS5Q9UPZ3 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
HPS5Q9UPZ3 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
HPS5Q9UPZ3 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
HPS5Q9UPZ3 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
HPS5Q9UPZ3 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
HPS5Q9UPZ3 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
HPS5Q9UPZ3 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
HPS5Q9UPZ3 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
HPS5Q9UPZ3 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
HPS5Q9UPZ3 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
HPS5Q9UPZ3 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
HPS5Q9UPZ3 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms