Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPX0

IGSF9B, Protein turtle homolog B, humanhuman

Predictions only

Length 1,349 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGSF9BQ9UPX0 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.61■■□□□ 1.37
IGSF9BQ9UPX0 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
IGSF9BQ9UPX0 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
IGSF9BQ9UPX0 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
IGSF9BQ9UPX0 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
IGSF9BQ9UPX0 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
IGSF9BQ9UPX0 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
IGSF9BQ9UPX0 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
IGSF9BQ9UPX0 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
IGSF9BQ9UPX0 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
IGSF9BQ9UPX0 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
IGSF9BQ9UPX0 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
IGSF9BQ9UPX0 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC23.6■■□□□ 1.37
IGSF9BQ9UPX0 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
IGSF9BQ9UPX0 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
IGSF9BQ9UPX0 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
IGSF9BQ9UPX0 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
IGSF9BQ9UPX0 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
IGSF9BQ9UPX0 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
IGSF9BQ9UPX0 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
IGSF9BQ9UPX0 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
IGSF9BQ9UPX0 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
IGSF9BQ9UPX0 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
IGSF9BQ9UPX0 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
IGSF9BQ9UPX0 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
IGSF9BQ9UPX0 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
IGSF9BQ9UPX0 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
IGSF9BQ9UPX0 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
IGSF9BQ9UPX0 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
IGSF9BQ9UPX0 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
IGSF9BQ9UPX0 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
IGSF9BQ9UPX0 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
IGSF9BQ9UPX0 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
IGSF9BQ9UPX0 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
IGSF9BQ9UPX0 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
IGSF9BQ9UPX0 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
IGSF9BQ9UPX0 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
IGSF9BQ9UPX0 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
IGSF9BQ9UPX0 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC23.59■■□□□ 1.37
IGSF9BQ9UPX0 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
IGSF9BQ9UPX0 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
IGSF9BQ9UPX0 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
IGSF9BQ9UPX0 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
IGSF9BQ9UPX0 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
IGSF9BQ9UPX0 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
IGSF9BQ9UPX0 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
IGSF9BQ9UPX0 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
IGSF9BQ9UPX0 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
IGSF9BQ9UPX0 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
IGSF9BQ9UPX0 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
IGSF9BQ9UPX0 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
IGSF9BQ9UPX0 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
IGSF9BQ9UPX0 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
IGSF9BQ9UPX0 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
IGSF9BQ9UPX0 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.36
IGSF9BQ9UPX0 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.36
IGSF9BQ9UPX0 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC23.58■■□□□ 1.36
IGSF9BQ9UPX0 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
IGSF9BQ9UPX0 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
IGSF9BQ9UPX0 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
IGSF9BQ9UPX0 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
IGSF9BQ9UPX0 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC23.58■■□□□ 1.36
IGSF9BQ9UPX0 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
IGSF9BQ9UPX0 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
IGSF9BQ9UPX0 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
IGSF9BQ9UPX0 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
IGSF9BQ9UPX0 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
IGSF9BQ9UPX0 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
IGSF9BQ9UPX0 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
IGSF9BQ9UPX0 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
IGSF9BQ9UPX0 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
IGSF9BQ9UPX0 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
IGSF9BQ9UPX0 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
IGSF9BQ9UPX0 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
IGSF9BQ9UPX0 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
IGSF9BQ9UPX0 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
IGSF9BQ9UPX0 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
IGSF9BQ9UPX0 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
IGSF9BQ9UPX0 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
IGSF9BQ9UPX0 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
IGSF9BQ9UPX0 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
IGSF9BQ9UPX0 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
IGSF9BQ9UPX0 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
IGSF9BQ9UPX0 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
IGSF9BQ9UPX0 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
IGSF9BQ9UPX0 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
IGSF9BQ9UPX0 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
IGSF9BQ9UPX0 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
IGSF9BQ9UPX0 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
IGSF9BQ9UPX0 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
IGSF9BQ9UPX0 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
IGSF9BQ9UPX0 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
IGSF9BQ9UPX0 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
IGSF9BQ9UPX0 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
IGSF9BQ9UPX0 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
IGSF9BQ9UPX0 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
IGSF9BQ9UPX0 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
IGSF9BQ9UPX0 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
IGSF9BQ9UPX0 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
IGSF9BQ9UPX0 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.3 ms