Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPP1

PHF8, Histone lysine demethylase PHF8, humanhuman

Predictions only

Length 1,060 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF8Q9UPP1 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
PHF8Q9UPP1 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
PHF8Q9UPP1 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
PHF8Q9UPP1 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
PHF8Q9UPP1 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
PHF8Q9UPP1 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.01■■■□□ 2.23
PHF8Q9UPP1 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
PHF8Q9UPP1 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
PHF8Q9UPP1 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
PHF8Q9UPP1 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
PHF8Q9UPP1 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
PHF8Q9UPP1 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
PHF8Q9UPP1 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
PHF8Q9UPP1 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
PHF8Q9UPP1 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC29■■■□□ 2.23
PHF8Q9UPP1 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
PHF8Q9UPP1 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
PHF8Q9UPP1 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
PHF8Q9UPP1 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
PHF8Q9UPP1 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
PHF8Q9UPP1 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
PHF8Q9UPP1 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.99■■■□□ 2.23
PHF8Q9UPP1 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
PHF8Q9UPP1 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
PHF8Q9UPP1 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
PHF8Q9UPP1 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
PHF8Q9UPP1 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
PHF8Q9UPP1 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
PHF8Q9UPP1 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
PHF8Q9UPP1 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
PHF8Q9UPP1 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
PHF8Q9UPP1 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
PHF8Q9UPP1 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
PHF8Q9UPP1 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC28.98■■■□□ 2.23
PHF8Q9UPP1 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
PHF8Q9UPP1 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
PHF8Q9UPP1 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
PHF8Q9UPP1 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
PHF8Q9UPP1 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.98■■■□□ 2.23
PHF8Q9UPP1 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
PHF8Q9UPP1 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
PHF8Q9UPP1 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
PHF8Q9UPP1 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
PHF8Q9UPP1 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
PHF8Q9UPP1 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
PHF8Q9UPP1 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
PHF8Q9UPP1 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
PHF8Q9UPP1 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
PHF8Q9UPP1 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
PHF8Q9UPP1 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC28.97■■■□□ 2.23
PHF8Q9UPP1 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
PHF8Q9UPP1 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.97■■■□□ 2.23
PHF8Q9UPP1 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
PHF8Q9UPP1 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
PHF8Q9UPP1 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC28.97■■■□□ 2.23
PHF8Q9UPP1 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
PHF8Q9UPP1 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
PHF8Q9UPP1 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
PHF8Q9UPP1 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
PHF8Q9UPP1 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
PHF8Q9UPP1 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
PHF8Q9UPP1 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
PHF8Q9UPP1 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
PHF8Q9UPP1 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
PHF8Q9UPP1 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC28.96■■■□□ 2.23
PHF8Q9UPP1 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
PHF8Q9UPP1 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
PHF8Q9UPP1 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
PHF8Q9UPP1 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC28.95■■■□□ 2.23
PHF8Q9UPP1 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.23
PHF8Q9UPP1 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
PHF8Q9UPP1 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
PHF8Q9UPP1 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
PHF8Q9UPP1 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
PHF8Q9UPP1 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
PHF8Q9UPP1 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
PHF8Q9UPP1 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
PHF8Q9UPP1 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC28.94■■■□□ 2.22
PHF8Q9UPP1 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
PHF8Q9UPP1 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC28.94■■■□□ 2.22
PHF8Q9UPP1 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
PHF8Q9UPP1 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC28.94■■■□□ 2.22
PHF8Q9UPP1 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
PHF8Q9UPP1 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
PHF8Q9UPP1 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
PHF8Q9UPP1 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
PHF8Q9UPP1 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
PHF8Q9UPP1 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
PHF8Q9UPP1 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC28.93■■■□□ 2.22
PHF8Q9UPP1 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
PHF8Q9UPP1 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
PHF8Q9UPP1 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.93■■■□□ 2.22
PHF8Q9UPP1 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC28.93■■■□□ 2.22
PHF8Q9UPP1 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC28.93■■■□□ 2.22
PHF8Q9UPP1 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
PHF8Q9UPP1 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
PHF8Q9UPP1 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
PHF8Q9UPP1 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
PHF8Q9UPP1 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
PHF8Q9UPP1 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms