Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULY5

CLEC4E, C-type lectin domain family 4 member E, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLEC4EQ9ULY5 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CLEC4EQ9ULY5 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CLEC4EQ9ULY5 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CLEC4EQ9ULY5 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CLEC4EQ9ULY5 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CLEC4EQ9ULY5 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CLEC4EQ9ULY5 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CLEC4EQ9ULY5 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CLEC4EQ9ULY5 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
CLEC4EQ9ULY5 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CLEC4EQ9ULY5 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CLEC4EQ9ULY5 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CLEC4EQ9ULY5 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CLEC4EQ9ULY5 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CLEC4EQ9ULY5 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CLEC4EQ9ULY5 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CLEC4EQ9ULY5 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
CLEC4EQ9ULY5 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CLEC4EQ9ULY5 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CLEC4EQ9ULY5 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
CLEC4EQ9ULY5 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
CLEC4EQ9ULY5 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CLEC4EQ9ULY5 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
CLEC4EQ9ULY5 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
CLEC4EQ9ULY5 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
CLEC4EQ9ULY5 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
CLEC4EQ9ULY5 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
CLEC4EQ9ULY5 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CLEC4EQ9ULY5 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CLEC4EQ9ULY5 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CLEC4EQ9ULY5 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CLEC4EQ9ULY5 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CLEC4EQ9ULY5 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CLEC4EQ9ULY5 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CLEC4EQ9ULY5 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CLEC4EQ9ULY5 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CLEC4EQ9ULY5 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CLEC4EQ9ULY5 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CLEC4EQ9ULY5 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CLEC4EQ9ULY5 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CLEC4EQ9ULY5 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CLEC4EQ9ULY5 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CLEC4EQ9ULY5 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CLEC4EQ9ULY5 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CLEC4EQ9ULY5 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CLEC4EQ9ULY5 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CLEC4EQ9ULY5 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CLEC4EQ9ULY5 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CLEC4EQ9ULY5 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CLEC4EQ9ULY5 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CLEC4EQ9ULY5 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CLEC4EQ9ULY5 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CLEC4EQ9ULY5 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CLEC4EQ9ULY5 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CLEC4EQ9ULY5 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CLEC4EQ9ULY5 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CLEC4EQ9ULY5 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CLEC4EQ9ULY5 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
CLEC4EQ9ULY5 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CLEC4EQ9ULY5 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
CLEC4EQ9ULY5 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CLEC4EQ9ULY5 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CLEC4EQ9ULY5 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CLEC4EQ9ULY5 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CLEC4EQ9ULY5 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
CLEC4EQ9ULY5 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CLEC4EQ9ULY5 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CLEC4EQ9ULY5 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CLEC4EQ9ULY5 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CLEC4EQ9ULY5 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CLEC4EQ9ULY5 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CLEC4EQ9ULY5 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CLEC4EQ9ULY5 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
CLEC4EQ9ULY5 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CLEC4EQ9ULY5 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CLEC4EQ9ULY5 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CLEC4EQ9ULY5 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CLEC4EQ9ULY5 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CLEC4EQ9ULY5 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CLEC4EQ9ULY5 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CLEC4EQ9ULY5 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
CLEC4EQ9ULY5 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CLEC4EQ9ULY5 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CLEC4EQ9ULY5 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CLEC4EQ9ULY5 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CLEC4EQ9ULY5 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CLEC4EQ9ULY5 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CLEC4EQ9ULY5 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
CLEC4EQ9ULY5 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CLEC4EQ9ULY5 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CLEC4EQ9ULY5 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CLEC4EQ9ULY5 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CLEC4EQ9ULY5 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CLEC4EQ9ULY5 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CLEC4EQ9ULY5 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CLEC4EQ9ULY5 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CLEC4EQ9ULY5 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CLEC4EQ9ULY5 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CLEC4EQ9ULY5 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CLEC4EQ9ULY5 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.3 ms