Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULI1

NWD2, NACHT and WD repeat domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,742 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NWD2Q9ULI1 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
NWD2Q9ULI1 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
NWD2Q9ULI1 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.27■■■□□ 2.12
NWD2Q9ULI1 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
NWD2Q9ULI1 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
NWD2Q9ULI1 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.12
NWD2Q9ULI1 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
NWD2Q9ULI1 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.12
NWD2Q9ULI1 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
NWD2Q9ULI1 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
NWD2Q9ULI1 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
NWD2Q9ULI1 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.12
NWD2Q9ULI1 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC28.26■■■□□ 2.12
NWD2Q9ULI1 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC28.26■■■□□ 2.12
NWD2Q9ULI1 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.11
NWD2Q9ULI1 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
NWD2Q9ULI1 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
NWD2Q9ULI1 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC28.26■■■□□ 2.11
NWD2Q9ULI1 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
NWD2Q9ULI1 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
NWD2Q9ULI1 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
NWD2Q9ULI1 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
NWD2Q9ULI1 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
NWD2Q9ULI1 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
NWD2Q9ULI1 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
NWD2Q9ULI1 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
NWD2Q9ULI1 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
NWD2Q9ULI1 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
NWD2Q9ULI1 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
NWD2Q9ULI1 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
NWD2Q9ULI1 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
NWD2Q9ULI1 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
NWD2Q9ULI1 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
NWD2Q9ULI1 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
NWD2Q9ULI1 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
NWD2Q9ULI1 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
NWD2Q9ULI1 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
NWD2Q9ULI1 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
NWD2Q9ULI1 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
NWD2Q9ULI1 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
NWD2Q9ULI1 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
NWD2Q9ULI1 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
NWD2Q9ULI1 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
NWD2Q9ULI1 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
NWD2Q9ULI1 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
NWD2Q9ULI1 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
NWD2Q9ULI1 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
NWD2Q9ULI1 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
NWD2Q9ULI1 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
NWD2Q9ULI1 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
NWD2Q9ULI1 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
NWD2Q9ULI1 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
NWD2Q9ULI1 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
NWD2Q9ULI1 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
NWD2Q9ULI1 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
NWD2Q9ULI1 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
NWD2Q9ULI1 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
NWD2Q9ULI1 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
NWD2Q9ULI1 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
NWD2Q9ULI1 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
NWD2Q9ULI1 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
NWD2Q9ULI1 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC28.22■■■□□ 2.11
NWD2Q9ULI1 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
NWD2Q9ULI1 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
NWD2Q9ULI1 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.21■■■□□ 2.11
NWD2Q9ULI1 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
NWD2Q9ULI1 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
NWD2Q9ULI1 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
NWD2Q9ULI1 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
NWD2Q9ULI1 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
NWD2Q9ULI1 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
NWD2Q9ULI1 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
NWD2Q9ULI1 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
NWD2Q9ULI1 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
NWD2Q9ULI1 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
NWD2Q9ULI1 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
NWD2Q9ULI1 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC28.21■■■□□ 2.11
NWD2Q9ULI1 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
NWD2Q9ULI1 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
NWD2Q9ULI1 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.11
NWD2Q9ULI1 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.11
NWD2Q9ULI1 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.11
NWD2Q9ULI1 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
NWD2Q9ULI1 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
NWD2Q9ULI1 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
NWD2Q9ULI1 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC28.2■■■□□ 2.1
NWD2Q9ULI1 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
NWD2Q9ULI1 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.1
NWD2Q9ULI1 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
NWD2Q9ULI1 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
NWD2Q9ULI1 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
NWD2Q9ULI1 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
NWD2Q9ULI1 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
NWD2Q9ULI1 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
NWD2Q9ULI1 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
NWD2Q9ULI1 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC28.19■■■□□ 2.1
NWD2Q9ULI1 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.19■■■□□ 2.1
NWD2Q9ULI1 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
NWD2Q9ULI1 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC28.19■■■□□ 2.1
NWD2Q9ULI1 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms