Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULD9

ZNF608, Zinc finger protein 608, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,512 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF608Q9ULD9 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC35.43■■■■□ 3.26
ZNF608Q9ULD9 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC35.43■■■■□ 3.26
ZNF608Q9ULD9 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC35.43■■■■□ 3.26
ZNF608Q9ULD9 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.43■■■■□ 3.26
ZNF608Q9ULD9 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC35.43■■■■□ 3.26
ZNF608Q9ULD9 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.42■■■■□ 3.26
ZNF608Q9ULD9 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC35.42■■■■□ 3.26
ZNF608Q9ULD9 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC35.42■■■■□ 3.26
ZNF608Q9ULD9 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.42■■■■□ 3.26
ZNF608Q9ULD9 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC35.42■■■■□ 3.26
ZNF608Q9ULD9 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC35.42■■■■□ 3.26
ZNF608Q9ULD9 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.42■■■■□ 3.26
ZNF608Q9ULD9 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC35.42■■■■□ 3.26
ZNF608Q9ULD9 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC35.42■■■■□ 3.26
ZNF608Q9ULD9 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC35.41■■■■□ 3.26
ZNF608Q9ULD9 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC35.41■■■■□ 3.26
ZNF608Q9ULD9 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC35.41■■■■□ 3.26
ZNF608Q9ULD9 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.41■■■■□ 3.26
ZNF608Q9ULD9 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.41■■■■□ 3.26
ZNF608Q9ULD9 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC35.41■■■■□ 3.26
ZNF608Q9ULD9 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC35.41■■■■□ 3.26
ZNF608Q9ULD9 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.41■■■■□ 3.26
ZNF608Q9ULD9 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC35.41■■■■□ 3.26
ZNF608Q9ULD9 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC35.41■■■■□ 3.26
ZNF608Q9ULD9 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC35.41■■■■□ 3.26
ZNF608Q9ULD9 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC35.41■■■■□ 3.26
ZNF608Q9ULD9 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC35.41■■■■□ 3.26
ZNF608Q9ULD9 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC35.41■■■■□ 3.26
ZNF608Q9ULD9 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC35.41■■■■□ 3.26
ZNF608Q9ULD9 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC35.4■■■■□ 3.26
ZNF608Q9ULD9 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.4■■■■□ 3.26
ZNF608Q9ULD9 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.4■■■■□ 3.26
ZNF608Q9ULD9 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.4■■■■□ 3.26
ZNF608Q9ULD9 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC35.4■■■■□ 3.26
ZNF608Q9ULD9 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.4■■■■□ 3.26
ZNF608Q9ULD9 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.39■■■■□ 3.26
ZNF608Q9ULD9 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC35.39■■■■□ 3.26
ZNF608Q9ULD9 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC35.39■■■■□ 3.26
ZNF608Q9ULD9 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.39■■■■□ 3.26
ZNF608Q9ULD9 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC35.39■■■■□ 3.26
ZNF608Q9ULD9 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.38■■■■□ 3.25
ZNF608Q9ULD9 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC35.38■■■■□ 3.25
ZNF608Q9ULD9 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC35.38■■■■□ 3.25
ZNF608Q9ULD9 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC35.38■■■■□ 3.25
ZNF608Q9ULD9 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC35.38■■■■□ 3.25
ZNF608Q9ULD9 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC35.37■■■■□ 3.25
ZNF608Q9ULD9 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.37■■■■□ 3.25
ZNF608Q9ULD9 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.37■■■■□ 3.25
ZNF608Q9ULD9 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC35.37■■■■□ 3.25
ZNF608Q9ULD9 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC35.37■■■■□ 3.25
ZNF608Q9ULD9 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC35.37■■■■□ 3.25
ZNF608Q9ULD9 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC35.37■■■■□ 3.25
ZNF608Q9ULD9 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC35.37■■■■□ 3.25
ZNF608Q9ULD9 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC35.37■■■■□ 3.25
ZNF608Q9ULD9 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.37■■■■□ 3.25
ZNF608Q9ULD9 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC35.37■■■■□ 3.25
ZNF608Q9ULD9 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.37■■■■□ 3.25
ZNF608Q9ULD9 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC35.37■■■■□ 3.25
ZNF608Q9ULD9 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC35.37■■■■□ 3.25
ZNF608Q9ULD9 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.37■■■■□ 3.25
ZNF608Q9ULD9 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.37■■■■□ 3.25
ZNF608Q9ULD9 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.36■■■■□ 3.25
ZNF608Q9ULD9 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC35.36■■■■□ 3.25
ZNF608Q9ULD9 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC35.36■■■■□ 3.25
ZNF608Q9ULD9 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC35.36■■■■□ 3.25
ZNF608Q9ULD9 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC35.36■■■■□ 3.25
ZNF608Q9ULD9 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.36■■■■□ 3.25
ZNF608Q9ULD9 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.36■■■■□ 3.25
ZNF608Q9ULD9 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC35.35■■■■□ 3.25
ZNF608Q9ULD9 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC35.35■■■■□ 3.25
ZNF608Q9ULD9 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.35■■■■□ 3.25
ZNF608Q9ULD9 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC35.35■■■■□ 3.25
ZNF608Q9ULD9 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC35.35■■■■□ 3.25
ZNF608Q9ULD9 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC35.35■■■■□ 3.25
ZNF608Q9ULD9 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC35.35■■■■□ 3.25
ZNF608Q9ULD9 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.35■■■■□ 3.25
ZNF608Q9ULD9 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.35■■■■□ 3.25
ZNF608Q9ULD9 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.35■■■■□ 3.25
ZNF608Q9ULD9 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC35.34■■■■□ 3.25
ZNF608Q9ULD9 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC35.34■■■■□ 3.25
ZNF608Q9ULD9 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.34■■■■□ 3.25
ZNF608Q9ULD9 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC35.34■■■■□ 3.25
ZNF608Q9ULD9 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC35.34■■■■□ 3.25
ZNF608Q9ULD9 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC35.34■■■■□ 3.25
ZNF608Q9ULD9 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC35.34■■■■□ 3.25
ZNF608Q9ULD9 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC35.34■■■■□ 3.25
ZNF608Q9ULD9 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC35.34■■■■□ 3.25
ZNF608Q9ULD9 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.34■■■■□ 3.25
ZNF608Q9ULD9 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC35.34■■■■□ 3.25
ZNF608Q9ULD9 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC35.34■■■■□ 3.25
ZNF608Q9ULD9 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.33■■■■□ 3.25
ZNF608Q9ULD9 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC35.33■■■■□ 3.25
ZNF608Q9ULD9 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC35.33■■■■□ 3.25
ZNF608Q9ULD9 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC35.33■■■■□ 3.25
ZNF608Q9ULD9 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.25
ZNF608Q9ULD9 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC35.32■■■■□ 3.25
ZNF608Q9ULD9 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC35.32■■■■□ 3.25
ZNF608Q9ULD9 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.25
ZNF608Q9ULD9 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC35.32■■■■□ 3.25
ZNF608Q9ULD9 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.32■■■■□ 3.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.4 ms