Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULB4

CDH9, Cadherin-9, humanhuman

Predictions only

Length 789 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH9Q9ULB4 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CDH9Q9ULB4 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CDH9Q9ULB4 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CDH9Q9ULB4 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CDH9Q9ULB4 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CDH9Q9ULB4 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CDH9Q9ULB4 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CDH9Q9ULB4 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CDH9Q9ULB4 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CDH9Q9ULB4 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CDH9Q9ULB4 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CDH9Q9ULB4 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CDH9Q9ULB4 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CDH9Q9ULB4 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CDH9Q9ULB4 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CDH9Q9ULB4 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CDH9Q9ULB4 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CDH9Q9ULB4 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CDH9Q9ULB4 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CDH9Q9ULB4 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CDH9Q9ULB4 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CDH9Q9ULB4 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CDH9Q9ULB4 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CDH9Q9ULB4 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CDH9Q9ULB4 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CDH9Q9ULB4 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CDH9Q9ULB4 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CDH9Q9ULB4 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CDH9Q9ULB4 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CDH9Q9ULB4 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CDH9Q9ULB4 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CDH9Q9ULB4 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
CDH9Q9ULB4 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CDH9Q9ULB4 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CDH9Q9ULB4 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CDH9Q9ULB4 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CDH9Q9ULB4 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CDH9Q9ULB4 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CDH9Q9ULB4 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CDH9Q9ULB4 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CDH9Q9ULB4 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CDH9Q9ULB4 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CDH9Q9ULB4 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CDH9Q9ULB4 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CDH9Q9ULB4 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CDH9Q9ULB4 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CDH9Q9ULB4 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CDH9Q9ULB4 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CDH9Q9ULB4 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CDH9Q9ULB4 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CDH9Q9ULB4 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CDH9Q9ULB4 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CDH9Q9ULB4 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CDH9Q9ULB4 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CDH9Q9ULB4 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
CDH9Q9ULB4 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CDH9Q9ULB4 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CDH9Q9ULB4 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CDH9Q9ULB4 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CDH9Q9ULB4 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CDH9Q9ULB4 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CDH9Q9ULB4 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CDH9Q9ULB4 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CDH9Q9ULB4 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CDH9Q9ULB4 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
CDH9Q9ULB4 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CDH9Q9ULB4 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CDH9Q9ULB4 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CDH9Q9ULB4 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CDH9Q9ULB4 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CDH9Q9ULB4 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CDH9Q9ULB4 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CDH9Q9ULB4 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CDH9Q9ULB4 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CDH9Q9ULB4 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CDH9Q9ULB4 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CDH9Q9ULB4 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CDH9Q9ULB4 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CDH9Q9ULB4 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CDH9Q9ULB4 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CDH9Q9ULB4 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CDH9Q9ULB4 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CDH9Q9ULB4 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CDH9Q9ULB4 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CDH9Q9ULB4 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CDH9Q9ULB4 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
CDH9Q9ULB4 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CDH9Q9ULB4 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
CDH9Q9ULB4 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
CDH9Q9ULB4 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CDH9Q9ULB4 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CDH9Q9ULB4 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CDH9Q9ULB4 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CDH9Q9ULB4 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CDH9Q9ULB4 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
CDH9Q9ULB4 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CDH9Q9ULB4 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
CDH9Q9ULB4 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CDH9Q9ULB4 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CDH9Q9ULB4 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms