Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJY5

GGA1, ADP-ribosylation factor-binding protein GGA1, humanhuman

Predictions only

Length 639 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGA1Q9UJY5 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
GGA1Q9UJY5 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
GGA1Q9UJY5 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
GGA1Q9UJY5 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
GGA1Q9UJY5 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
GGA1Q9UJY5 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
GGA1Q9UJY5 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
GGA1Q9UJY5 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
GGA1Q9UJY5 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
GGA1Q9UJY5 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
GGA1Q9UJY5 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
GGA1Q9UJY5 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
GGA1Q9UJY5 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
GGA1Q9UJY5 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
GGA1Q9UJY5 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
GGA1Q9UJY5 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
GGA1Q9UJY5 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
GGA1Q9UJY5 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
GGA1Q9UJY5 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
GGA1Q9UJY5 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
GGA1Q9UJY5 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
GGA1Q9UJY5 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
GGA1Q9UJY5 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
GGA1Q9UJY5 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
GGA1Q9UJY5 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
GGA1Q9UJY5 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
GGA1Q9UJY5 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
GGA1Q9UJY5 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
GGA1Q9UJY5 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
GGA1Q9UJY5 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
GGA1Q9UJY5 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
GGA1Q9UJY5 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
GGA1Q9UJY5 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
GGA1Q9UJY5 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
GGA1Q9UJY5 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
GGA1Q9UJY5 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
GGA1Q9UJY5 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
GGA1Q9UJY5 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
GGA1Q9UJY5 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
GGA1Q9UJY5 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
GGA1Q9UJY5 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
GGA1Q9UJY5 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.75■■□□□ 1.71
GGA1Q9UJY5 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
GGA1Q9UJY5 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
GGA1Q9UJY5 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
GGA1Q9UJY5 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
GGA1Q9UJY5 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
GGA1Q9UJY5 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
GGA1Q9UJY5 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
GGA1Q9UJY5 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
GGA1Q9UJY5 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
GGA1Q9UJY5 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
GGA1Q9UJY5 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
GGA1Q9UJY5 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
GGA1Q9UJY5 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
GGA1Q9UJY5 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
GGA1Q9UJY5 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
GGA1Q9UJY5 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
GGA1Q9UJY5 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC25.74■■□□□ 1.71
GGA1Q9UJY5 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
GGA1Q9UJY5 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
GGA1Q9UJY5 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
GGA1Q9UJY5 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
GGA1Q9UJY5 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
GGA1Q9UJY5 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
GGA1Q9UJY5 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
GGA1Q9UJY5 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
GGA1Q9UJY5 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
GGA1Q9UJY5 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
GGA1Q9UJY5 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC25.73■■□□□ 1.71
GGA1Q9UJY5 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
GGA1Q9UJY5 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
GGA1Q9UJY5 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
GGA1Q9UJY5 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
GGA1Q9UJY5 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
GGA1Q9UJY5 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
GGA1Q9UJY5 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
GGA1Q9UJY5 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
GGA1Q9UJY5 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
GGA1Q9UJY5 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
GGA1Q9UJY5 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
GGA1Q9UJY5 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
GGA1Q9UJY5 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
GGA1Q9UJY5 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
GGA1Q9UJY5 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
GGA1Q9UJY5 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
GGA1Q9UJY5 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
GGA1Q9UJY5 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
GGA1Q9UJY5 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
GGA1Q9UJY5 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC25.72■■□□□ 1.71
GGA1Q9UJY5 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
GGA1Q9UJY5 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC25.72■■□□□ 1.71
GGA1Q9UJY5 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
GGA1Q9UJY5 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
GGA1Q9UJY5 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
GGA1Q9UJY5 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
GGA1Q9UJY5 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
GGA1Q9UJY5 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
GGA1Q9UJY5 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
GGA1Q9UJY5 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms