Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHC6

CNTNAP2, Contactin-associated protein-like 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTNAP2Q9UHC6 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CNTNAP2Q9UHC6 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CNTNAP2Q9UHC6 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CNTNAP2Q9UHC6 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CNTNAP2Q9UHC6 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CNTNAP2Q9UHC6 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CNTNAP2Q9UHC6 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CNTNAP2Q9UHC6 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CNTNAP2Q9UHC6 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CNTNAP2Q9UHC6 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CNTNAP2Q9UHC6 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CNTNAP2Q9UHC6 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CNTNAP2Q9UHC6 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CNTNAP2Q9UHC6 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CNTNAP2Q9UHC6 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CNTNAP2Q9UHC6 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
CNTNAP2Q9UHC6 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
CNTNAP2Q9UHC6 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
CNTNAP2Q9UHC6 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CNTNAP2Q9UHC6 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CNTNAP2Q9UHC6 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CNTNAP2Q9UHC6 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CNTNAP2Q9UHC6 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CNTNAP2Q9UHC6 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CNTNAP2Q9UHC6 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CNTNAP2Q9UHC6 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CNTNAP2Q9UHC6 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CNTNAP2Q9UHC6 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CNTNAP2Q9UHC6 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CNTNAP2Q9UHC6 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
CNTNAP2Q9UHC6 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
CNTNAP2Q9UHC6 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CNTNAP2Q9UHC6 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CNTNAP2Q9UHC6 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CNTNAP2Q9UHC6 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
CNTNAP2Q9UHC6 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CNTNAP2Q9UHC6 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CNTNAP2Q9UHC6 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CNTNAP2Q9UHC6 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CNTNAP2Q9UHC6 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CNTNAP2Q9UHC6 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CNTNAP2Q9UHC6 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CNTNAP2Q9UHC6 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CNTNAP2Q9UHC6 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CNTNAP2Q9UHC6 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CNTNAP2Q9UHC6 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CNTNAP2Q9UHC6 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CNTNAP2Q9UHC6 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CNTNAP2Q9UHC6 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CNTNAP2Q9UHC6 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CNTNAP2Q9UHC6 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CNTNAP2Q9UHC6 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CNTNAP2Q9UHC6 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CNTNAP2Q9UHC6 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CNTNAP2Q9UHC6 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CNTNAP2Q9UHC6 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CNTNAP2Q9UHC6 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CNTNAP2Q9UHC6 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
CNTNAP2Q9UHC6 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
CNTNAP2Q9UHC6 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CNTNAP2Q9UHC6 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CNTNAP2Q9UHC6 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CNTNAP2Q9UHC6 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CNTNAP2Q9UHC6 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CNTNAP2Q9UHC6 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
CNTNAP2Q9UHC6 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
CNTNAP2Q9UHC6 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
CNTNAP2Q9UHC6 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
CNTNAP2Q9UHC6 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
CNTNAP2Q9UHC6 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
CNTNAP2Q9UHC6 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
CNTNAP2Q9UHC6 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
CNTNAP2Q9UHC6 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.28
CNTNAP2Q9UHC6 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CNTNAP2Q9UHC6 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CNTNAP2Q9UHC6 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CNTNAP2Q9UHC6 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CNTNAP2Q9UHC6 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CNTNAP2Q9UHC6 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CNTNAP2Q9UHC6 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CNTNAP2Q9UHC6 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CNTNAP2Q9UHC6 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CNTNAP2Q9UHC6 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CNTNAP2Q9UHC6 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
CNTNAP2Q9UHC6 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
CNTNAP2Q9UHC6 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CNTNAP2Q9UHC6 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CNTNAP2Q9UHC6 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CNTNAP2Q9UHC6 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CNTNAP2Q9UHC6 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CNTNAP2Q9UHC6 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
CNTNAP2Q9UHC6 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CNTNAP2Q9UHC6 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CNTNAP2Q9UHC6 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CNTNAP2Q9UHC6 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CNTNAP2Q9UHC6 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CNTNAP2Q9UHC6 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CNTNAP2Q9UHC6 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CNTNAP2Q9UHC6 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
CNTNAP2Q9UHC6 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.7 ms