Protein–RNA interactions for Protein: Q9UFF9

CNOT8, CCR4-NOT transcription complex subunit 8, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNOT8Q9UFF9 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CNOT8Q9UFF9 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CNOT8Q9UFF9 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CNOT8Q9UFF9 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CNOT8Q9UFF9 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CNOT8Q9UFF9 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CNOT8Q9UFF9 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CNOT8Q9UFF9 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CNOT8Q9UFF9 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CNOT8Q9UFF9 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CNOT8Q9UFF9 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CNOT8Q9UFF9 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CNOT8Q9UFF9 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CNOT8Q9UFF9 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CNOT8Q9UFF9 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CNOT8Q9UFF9 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CNOT8Q9UFF9 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CNOT8Q9UFF9 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CNOT8Q9UFF9 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CNOT8Q9UFF9 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CNOT8Q9UFF9 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CNOT8Q9UFF9 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CNOT8Q9UFF9 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CNOT8Q9UFF9 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CNOT8Q9UFF9 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CNOT8Q9UFF9 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CNOT8Q9UFF9 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CNOT8Q9UFF9 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CNOT8Q9UFF9 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
CNOT8Q9UFF9 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CNOT8Q9UFF9 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
CNOT8Q9UFF9 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CNOT8Q9UFF9 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CNOT8Q9UFF9 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CNOT8Q9UFF9 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
CNOT8Q9UFF9 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CNOT8Q9UFF9 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CNOT8Q9UFF9 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CNOT8Q9UFF9 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CNOT8Q9UFF9 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CNOT8Q9UFF9 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CNOT8Q9UFF9 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CNOT8Q9UFF9 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CNOT8Q9UFF9 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CNOT8Q9UFF9 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CNOT8Q9UFF9 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CNOT8Q9UFF9 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CNOT8Q9UFF9 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CNOT8Q9UFF9 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CNOT8Q9UFF9 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CNOT8Q9UFF9 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
CNOT8Q9UFF9 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CNOT8Q9UFF9 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CNOT8Q9UFF9 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CNOT8Q9UFF9 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CNOT8Q9UFF9 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CNOT8Q9UFF9 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CNOT8Q9UFF9 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CNOT8Q9UFF9 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CNOT8Q9UFF9 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CNOT8Q9UFF9 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CNOT8Q9UFF9 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CNOT8Q9UFF9 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CNOT8Q9UFF9 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CNOT8Q9UFF9 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CNOT8Q9UFF9 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CNOT8Q9UFF9 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CNOT8Q9UFF9 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CNOT8Q9UFF9 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CNOT8Q9UFF9 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CNOT8Q9UFF9 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
CNOT8Q9UFF9 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CNOT8Q9UFF9 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CNOT8Q9UFF9 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CNOT8Q9UFF9 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CNOT8Q9UFF9 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CNOT8Q9UFF9 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CNOT8Q9UFF9 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CNOT8Q9UFF9 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CNOT8Q9UFF9 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CNOT8Q9UFF9 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CNOT8Q9UFF9 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CNOT8Q9UFF9 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CNOT8Q9UFF9 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CNOT8Q9UFF9 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CNOT8Q9UFF9 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CNOT8Q9UFF9 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CNOT8Q9UFF9 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CNOT8Q9UFF9 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CNOT8Q9UFF9 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CNOT8Q9UFF9 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CNOT8Q9UFF9 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CNOT8Q9UFF9 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CNOT8Q9UFF9 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CNOT8Q9UFF9 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CNOT8Q9UFF9 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CNOT8Q9UFF9 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CNOT8Q9UFF9 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
CNOT8Q9UFF9 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CNOT8Q9UFF9 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms