Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBY8

CLN8, Protein CLN8, humanhuman

Predictions only

Length 286 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN8Q9UBY8 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CLN8Q9UBY8 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CLN8Q9UBY8 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CLN8Q9UBY8 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CLN8Q9UBY8 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CLN8Q9UBY8 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CLN8Q9UBY8 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CLN8Q9UBY8 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CLN8Q9UBY8 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CLN8Q9UBY8 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CLN8Q9UBY8 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
CLN8Q9UBY8 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CLN8Q9UBY8 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CLN8Q9UBY8 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CLN8Q9UBY8 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CLN8Q9UBY8 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CLN8Q9UBY8 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CLN8Q9UBY8 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CLN8Q9UBY8 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CLN8Q9UBY8 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
CLN8Q9UBY8 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CLN8Q9UBY8 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CLN8Q9UBY8 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CLN8Q9UBY8 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CLN8Q9UBY8 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CLN8Q9UBY8 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CLN8Q9UBY8 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CLN8Q9UBY8 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CLN8Q9UBY8 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CLN8Q9UBY8 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CLN8Q9UBY8 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CLN8Q9UBY8 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CLN8Q9UBY8 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CLN8Q9UBY8 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CLN8Q9UBY8 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CLN8Q9UBY8 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CLN8Q9UBY8 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CLN8Q9UBY8 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
CLN8Q9UBY8 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
CLN8Q9UBY8 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
CLN8Q9UBY8 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
CLN8Q9UBY8 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC17.77■□□□□ 0.43
CLN8Q9UBY8 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
CLN8Q9UBY8 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
CLN8Q9UBY8 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
CLN8Q9UBY8 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CLN8Q9UBY8 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
CLN8Q9UBY8 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CLN8Q9UBY8 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CLN8Q9UBY8 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CLN8Q9UBY8 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
CLN8Q9UBY8 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CLN8Q9UBY8 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
CLN8Q9UBY8 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CLN8Q9UBY8 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CLN8Q9UBY8 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CLN8Q9UBY8 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
CLN8Q9UBY8 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CLN8Q9UBY8 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CLN8Q9UBY8 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CLN8Q9UBY8 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CLN8Q9UBY8 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CLN8Q9UBY8 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CLN8Q9UBY8 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CLN8Q9UBY8 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CLN8Q9UBY8 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CLN8Q9UBY8 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CLN8Q9UBY8 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CLN8Q9UBY8 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CLN8Q9UBY8 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CLN8Q9UBY8 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CLN8Q9UBY8 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CLN8Q9UBY8 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CLN8Q9UBY8 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CLN8Q9UBY8 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CLN8Q9UBY8 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CLN8Q9UBY8 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CLN8Q9UBY8 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CLN8Q9UBY8 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CLN8Q9UBY8 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CLN8Q9UBY8 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CLN8Q9UBY8 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CLN8Q9UBY8 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CLN8Q9UBY8 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CLN8Q9UBY8 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
CLN8Q9UBY8 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CLN8Q9UBY8 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CLN8Q9UBY8 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CLN8Q9UBY8 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CLN8Q9UBY8 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CLN8Q9UBY8 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CLN8Q9UBY8 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CLN8Q9UBY8 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CLN8Q9UBY8 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CLN8Q9UBY8 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CLN8Q9UBY8 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CLN8Q9UBY8 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CLN8Q9UBY8 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
CLN8Q9UBY8 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CLN8Q9UBY8 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms