Protein–RNA interactions for Protein: Q9P275

USP36, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 36, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,121 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP36Q9P275 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
USP36Q9P275 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
USP36Q9P275 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
USP36Q9P275 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
USP36Q9P275 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
USP36Q9P275 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
USP36Q9P275 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
USP36Q9P275 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
USP36Q9P275 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
USP36Q9P275 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
USP36Q9P275 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
USP36Q9P275 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
USP36Q9P275 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
USP36Q9P275 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
USP36Q9P275 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
USP36Q9P275 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
USP36Q9P275 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
USP36Q9P275 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
USP36Q9P275 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
USP36Q9P275 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
USP36Q9P275 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
USP36Q9P275 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
USP36Q9P275 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
USP36Q9P275 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
USP36Q9P275 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
USP36Q9P275 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC21.07■□□□□ 0.96
USP36Q9P275 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
USP36Q9P275 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
USP36Q9P275 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
USP36Q9P275 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
USP36Q9P275 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
USP36Q9P275 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
USP36Q9P275 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
USP36Q9P275 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
USP36Q9P275 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
USP36Q9P275 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
USP36Q9P275 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
USP36Q9P275 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
USP36Q9P275 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
USP36Q9P275 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
USP36Q9P275 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
USP36Q9P275 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
USP36Q9P275 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
USP36Q9P275 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
USP36Q9P275 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
USP36Q9P275 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
USP36Q9P275 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
USP36Q9P275 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
USP36Q9P275 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
USP36Q9P275 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
USP36Q9P275 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
USP36Q9P275 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
USP36Q9P275 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
USP36Q9P275 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
USP36Q9P275 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
USP36Q9P275 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
USP36Q9P275 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
USP36Q9P275 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
USP36Q9P275 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
USP36Q9P275 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
USP36Q9P275 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
USP36Q9P275 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
USP36Q9P275 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
USP36Q9P275 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
USP36Q9P275 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
USP36Q9P275 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC21.04■□□□□ 0.96
USP36Q9P275 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
USP36Q9P275 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
USP36Q9P275 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
USP36Q9P275 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
USP36Q9P275 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
USP36Q9P275 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
USP36Q9P275 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
USP36Q9P275 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
USP36Q9P275 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
USP36Q9P275 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
USP36Q9P275 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
USP36Q9P275 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
USP36Q9P275 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
USP36Q9P275 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
USP36Q9P275 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
USP36Q9P275 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
USP36Q9P275 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
USP36Q9P275 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
USP36Q9P275 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
USP36Q9P275 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
USP36Q9P275 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
USP36Q9P275 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
USP36Q9P275 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
USP36Q9P275 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
USP36Q9P275 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
USP36Q9P275 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
USP36Q9P275 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
USP36Q9P275 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
USP36Q9P275 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
USP36Q9P275 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
USP36Q9P275 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
USP36Q9P275 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
USP36Q9P275 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
USP36Q9P275 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms