Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1Z3

HCN3, Potassium/sodium hyperpolarization-activated cyclic nucleotide-gated channel 3, humanhuman

Predictions only

Length 774 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HCN3Q9P1Z3 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
HCN3Q9P1Z3 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
HCN3Q9P1Z3 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
HCN3Q9P1Z3 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
HCN3Q9P1Z3 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
HCN3Q9P1Z3 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
HCN3Q9P1Z3 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
HCN3Q9P1Z3 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
HCN3Q9P1Z3 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
HCN3Q9P1Z3 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
HCN3Q9P1Z3 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
HCN3Q9P1Z3 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
HCN3Q9P1Z3 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
HCN3Q9P1Z3 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
HCN3Q9P1Z3 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
HCN3Q9P1Z3 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
HCN3Q9P1Z3 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
HCN3Q9P1Z3 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
HCN3Q9P1Z3 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
HCN3Q9P1Z3 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
HCN3Q9P1Z3 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
HCN3Q9P1Z3 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
HCN3Q9P1Z3 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
HCN3Q9P1Z3 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
HCN3Q9P1Z3 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
HCN3Q9P1Z3 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
HCN3Q9P1Z3 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
HCN3Q9P1Z3 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
HCN3Q9P1Z3 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
HCN3Q9P1Z3 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
HCN3Q9P1Z3 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
HCN3Q9P1Z3 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
HCN3Q9P1Z3 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
HCN3Q9P1Z3 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
HCN3Q9P1Z3 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
HCN3Q9P1Z3 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
HCN3Q9P1Z3 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
HCN3Q9P1Z3 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
HCN3Q9P1Z3 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
HCN3Q9P1Z3 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
HCN3Q9P1Z3 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
HCN3Q9P1Z3 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
HCN3Q9P1Z3 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
HCN3Q9P1Z3 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
HCN3Q9P1Z3 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
HCN3Q9P1Z3 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
HCN3Q9P1Z3 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
HCN3Q9P1Z3 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
HCN3Q9P1Z3 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
HCN3Q9P1Z3 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
HCN3Q9P1Z3 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
HCN3Q9P1Z3 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
HCN3Q9P1Z3 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
HCN3Q9P1Z3 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
HCN3Q9P1Z3 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
HCN3Q9P1Z3 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
HCN3Q9P1Z3 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
HCN3Q9P1Z3 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC20■□□□□ 0.79
HCN3Q9P1Z3 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
HCN3Q9P1Z3 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
HCN3Q9P1Z3 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
HCN3Q9P1Z3 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
HCN3Q9P1Z3 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC20■□□□□ 0.79
HCN3Q9P1Z3 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
HCN3Q9P1Z3 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
HCN3Q9P1Z3 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
HCN3Q9P1Z3 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
HCN3Q9P1Z3 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
HCN3Q9P1Z3 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
HCN3Q9P1Z3 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
HCN3Q9P1Z3 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
HCN3Q9P1Z3 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
HCN3Q9P1Z3 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
HCN3Q9P1Z3 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
HCN3Q9P1Z3 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
HCN3Q9P1Z3 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
HCN3Q9P1Z3 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
HCN3Q9P1Z3 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
HCN3Q9P1Z3 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
HCN3Q9P1Z3 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
HCN3Q9P1Z3 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
HCN3Q9P1Z3 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
HCN3Q9P1Z3 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
HCN3Q9P1Z3 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
HCN3Q9P1Z3 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
HCN3Q9P1Z3 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
HCN3Q9P1Z3 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
HCN3Q9P1Z3 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
HCN3Q9P1Z3 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
HCN3Q9P1Z3 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
HCN3Q9P1Z3 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
HCN3Q9P1Z3 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
HCN3Q9P1Z3 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
HCN3Q9P1Z3 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
HCN3Q9P1Z3 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
HCN3Q9P1Z3 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
HCN3Q9P1Z3 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
HCN3Q9P1Z3 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
HCN3Q9P1Z3 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
HCN3Q9P1Z3 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.3 ms