Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0W2

HMG20B, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily E member 1-related, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMG20BQ9P0W2 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
HMG20BQ9P0W2 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
HMG20BQ9P0W2 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
HMG20BQ9P0W2 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
HMG20BQ9P0W2 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
HMG20BQ9P0W2 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
HMG20BQ9P0W2 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
HMG20BQ9P0W2 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
HMG20BQ9P0W2 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
HMG20BQ9P0W2 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
HMG20BQ9P0W2 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
HMG20BQ9P0W2 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
HMG20BQ9P0W2 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
HMG20BQ9P0W2 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
HMG20BQ9P0W2 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
HMG20BQ9P0W2 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
HMG20BQ9P0W2 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
HMG20BQ9P0W2 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
HMG20BQ9P0W2 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
HMG20BQ9P0W2 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
HMG20BQ9P0W2 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
HMG20BQ9P0W2 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
HMG20BQ9P0W2 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
HMG20BQ9P0W2 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
HMG20BQ9P0W2 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
HMG20BQ9P0W2 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
HMG20BQ9P0W2 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
HMG20BQ9P0W2 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC25.74■■□□□ 1.71
HMG20BQ9P0W2 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
HMG20BQ9P0W2 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
HMG20BQ9P0W2 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
HMG20BQ9P0W2 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
HMG20BQ9P0W2 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
HMG20BQ9P0W2 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
HMG20BQ9P0W2 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
HMG20BQ9P0W2 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
HMG20BQ9P0W2 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
HMG20BQ9P0W2 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
HMG20BQ9P0W2 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
HMG20BQ9P0W2 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
HMG20BQ9P0W2 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
HMG20BQ9P0W2 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
HMG20BQ9P0W2 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
HMG20BQ9P0W2 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
HMG20BQ9P0W2 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
HMG20BQ9P0W2 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
HMG20BQ9P0W2 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
HMG20BQ9P0W2 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
HMG20BQ9P0W2 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
HMG20BQ9P0W2 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
HMG20BQ9P0W2 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
HMG20BQ9P0W2 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
HMG20BQ9P0W2 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
HMG20BQ9P0W2 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
HMG20BQ9P0W2 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
HMG20BQ9P0W2 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
HMG20BQ9P0W2 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
HMG20BQ9P0W2 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
HMG20BQ9P0W2 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC25.72■■□□□ 1.71
HMG20BQ9P0W2 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
HMG20BQ9P0W2 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
HMG20BQ9P0W2 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
HMG20BQ9P0W2 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
HMG20BQ9P0W2 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
HMG20BQ9P0W2 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
HMG20BQ9P0W2 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
HMG20BQ9P0W2 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
HMG20BQ9P0W2 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
HMG20BQ9P0W2 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
HMG20BQ9P0W2 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
HMG20BQ9P0W2 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC25.71■■□□□ 1.71
HMG20BQ9P0W2 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
HMG20BQ9P0W2 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
HMG20BQ9P0W2 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
HMG20BQ9P0W2 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
HMG20BQ9P0W2 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
HMG20BQ9P0W2 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
HMG20BQ9P0W2 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
HMG20BQ9P0W2 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
HMG20BQ9P0W2 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
HMG20BQ9P0W2 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
HMG20BQ9P0W2 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
HMG20BQ9P0W2 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
HMG20BQ9P0W2 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
HMG20BQ9P0W2 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
HMG20BQ9P0W2 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
HMG20BQ9P0W2 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
HMG20BQ9P0W2 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
HMG20BQ9P0W2 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.7■■□□□ 1.7
HMG20BQ9P0W2 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
HMG20BQ9P0W2 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC25.7■■□□□ 1.7
HMG20BQ9P0W2 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
HMG20BQ9P0W2 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
HMG20BQ9P0W2 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
HMG20BQ9P0W2 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
HMG20BQ9P0W2 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
HMG20BQ9P0W2 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
HMG20BQ9P0W2 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
HMG20BQ9P0W2 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
HMG20BQ9P0W2 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.9 ms