Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZ63

C9orf78, Telomere length and silencing protein 1 homolog, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf78Q9NZ63 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
C9orf78Q9NZ63 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
C9orf78Q9NZ63 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
C9orf78Q9NZ63 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
C9orf78Q9NZ63 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
C9orf78Q9NZ63 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
C9orf78Q9NZ63 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
C9orf78Q9NZ63 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
C9orf78Q9NZ63 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
C9orf78Q9NZ63 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
C9orf78Q9NZ63 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
C9orf78Q9NZ63 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC26.51■■□□□ 1.83
C9orf78Q9NZ63 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
C9orf78Q9NZ63 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
C9orf78Q9NZ63 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
C9orf78Q9NZ63 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
C9orf78Q9NZ63 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
C9orf78Q9NZ63 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
C9orf78Q9NZ63 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
C9orf78Q9NZ63 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
C9orf78Q9NZ63 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
C9orf78Q9NZ63 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
C9orf78Q9NZ63 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
C9orf78Q9NZ63 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
C9orf78Q9NZ63 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
C9orf78Q9NZ63 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
C9orf78Q9NZ63 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC26.49■■□□□ 1.83
C9orf78Q9NZ63 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
C9orf78Q9NZ63 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
C9orf78Q9NZ63 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
C9orf78Q9NZ63 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
C9orf78Q9NZ63 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
C9orf78Q9NZ63 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC26.48■■□□□ 1.83
C9orf78Q9NZ63 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.48■■□□□ 1.83
C9orf78Q9NZ63 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
C9orf78Q9NZ63 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
C9orf78Q9NZ63 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
C9orf78Q9NZ63 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
C9orf78Q9NZ63 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
C9orf78Q9NZ63 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
C9orf78Q9NZ63 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
C9orf78Q9NZ63 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
C9orf78Q9NZ63 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
C9orf78Q9NZ63 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
C9orf78Q9NZ63 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
C9orf78Q9NZ63 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
C9orf78Q9NZ63 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
C9orf78Q9NZ63 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
C9orf78Q9NZ63 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
C9orf78Q9NZ63 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
C9orf78Q9NZ63 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
C9orf78Q9NZ63 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
C9orf78Q9NZ63 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
C9orf78Q9NZ63 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
C9orf78Q9NZ63 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
C9orf78Q9NZ63 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
C9orf78Q9NZ63 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC26.47■■□□□ 1.83
C9orf78Q9NZ63 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
C9orf78Q9NZ63 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
C9orf78Q9NZ63 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
C9orf78Q9NZ63 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
C9orf78Q9NZ63 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
C9orf78Q9NZ63 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
C9orf78Q9NZ63 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
C9orf78Q9NZ63 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
C9orf78Q9NZ63 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
C9orf78Q9NZ63 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
C9orf78Q9NZ63 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
C9orf78Q9NZ63 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
C9orf78Q9NZ63 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
C9orf78Q9NZ63 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
C9orf78Q9NZ63 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
C9orf78Q9NZ63 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
C9orf78Q9NZ63 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
C9orf78Q9NZ63 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
C9orf78Q9NZ63 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
C9orf78Q9NZ63 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
C9orf78Q9NZ63 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
C9orf78Q9NZ63 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
C9orf78Q9NZ63 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
C9orf78Q9NZ63 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
C9orf78Q9NZ63 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC26.45■■□□□ 1.82
C9orf78Q9NZ63 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
C9orf78Q9NZ63 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
C9orf78Q9NZ63 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
C9orf78Q9NZ63 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
C9orf78Q9NZ63 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
C9orf78Q9NZ63 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
C9orf78Q9NZ63 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
C9orf78Q9NZ63 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
C9orf78Q9NZ63 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
C9orf78Q9NZ63 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
C9orf78Q9NZ63 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
C9orf78Q9NZ63 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
C9orf78Q9NZ63 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
C9orf78Q9NZ63 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
C9orf78Q9NZ63 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
C9orf78Q9NZ63 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
C9orf78Q9NZ63 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC26.44■■□□□ 1.82
C9orf78Q9NZ63 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms