Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYP9

MIS18A, Protein Mis18-alpha, humanhuman

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Length 233 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MIS18AQ9NYP9 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
MIS18AQ9NYP9 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
MIS18AQ9NYP9 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
MIS18AQ9NYP9 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
MIS18AQ9NYP9 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
MIS18AQ9NYP9 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
MIS18AQ9NYP9 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
MIS18AQ9NYP9 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
MIS18AQ9NYP9 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
MIS18AQ9NYP9 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
MIS18AQ9NYP9 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
MIS18AQ9NYP9 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
MIS18AQ9NYP9 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
MIS18AQ9NYP9 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
MIS18AQ9NYP9 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
MIS18AQ9NYP9 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
MIS18AQ9NYP9 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
MIS18AQ9NYP9 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
MIS18AQ9NYP9 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
MIS18AQ9NYP9 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
MIS18AQ9NYP9 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
MIS18AQ9NYP9 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
MIS18AQ9NYP9 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
MIS18AQ9NYP9 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
MIS18AQ9NYP9 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
MIS18AQ9NYP9 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
MIS18AQ9NYP9 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
MIS18AQ9NYP9 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
MIS18AQ9NYP9 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
MIS18AQ9NYP9 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
MIS18AQ9NYP9 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
MIS18AQ9NYP9 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
MIS18AQ9NYP9 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
MIS18AQ9NYP9 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
MIS18AQ9NYP9 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
MIS18AQ9NYP9 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
MIS18AQ9NYP9 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
MIS18AQ9NYP9 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
MIS18AQ9NYP9 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
MIS18AQ9NYP9 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
MIS18AQ9NYP9 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
MIS18AQ9NYP9 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
MIS18AQ9NYP9 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
MIS18AQ9NYP9 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
MIS18AQ9NYP9 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
MIS18AQ9NYP9 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
MIS18AQ9NYP9 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
MIS18AQ9NYP9 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
MIS18AQ9NYP9 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
MIS18AQ9NYP9 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
MIS18AQ9NYP9 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
MIS18AQ9NYP9 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
MIS18AQ9NYP9 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
MIS18AQ9NYP9 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
MIS18AQ9NYP9 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
MIS18AQ9NYP9 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
MIS18AQ9NYP9 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
MIS18AQ9NYP9 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
MIS18AQ9NYP9 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
MIS18AQ9NYP9 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
MIS18AQ9NYP9 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
MIS18AQ9NYP9 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
MIS18AQ9NYP9 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
MIS18AQ9NYP9 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
MIS18AQ9NYP9 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
MIS18AQ9NYP9 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC27.33■■□□□ 1.97
MIS18AQ9NYP9 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
MIS18AQ9NYP9 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
MIS18AQ9NYP9 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
MIS18AQ9NYP9 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
MIS18AQ9NYP9 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
MIS18AQ9NYP9 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
MIS18AQ9NYP9 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
MIS18AQ9NYP9 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
MIS18AQ9NYP9 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
MIS18AQ9NYP9 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
MIS18AQ9NYP9 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
MIS18AQ9NYP9 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
MIS18AQ9NYP9 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
MIS18AQ9NYP9 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
MIS18AQ9NYP9 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
MIS18AQ9NYP9 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
MIS18AQ9NYP9 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
MIS18AQ9NYP9 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
MIS18AQ9NYP9 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
MIS18AQ9NYP9 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
MIS18AQ9NYP9 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
MIS18AQ9NYP9 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
MIS18AQ9NYP9 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
MIS18AQ9NYP9 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
MIS18AQ9NYP9 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
MIS18AQ9NYP9 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC27.31■■□□□ 1.96
MIS18AQ9NYP9 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
MIS18AQ9NYP9 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
MIS18AQ9NYP9 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
MIS18AQ9NYP9 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
MIS18AQ9NYP9 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
MIS18AQ9NYP9 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
MIS18AQ9NYP9 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
MIS18AQ9NYP9 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
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