Protein–RNA interactions for Protein: Q9NY84

VNN3, Vascular non-inflammatory molecule 3, humanhuman

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VNN3Q9NY84 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
VNN3Q9NY84 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
VNN3Q9NY84 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
VNN3Q9NY84 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
VNN3Q9NY84 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
VNN3Q9NY84 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
VNN3Q9NY84 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
VNN3Q9NY84 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
VNN3Q9NY84 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
VNN3Q9NY84 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
VNN3Q9NY84 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
VNN3Q9NY84 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
VNN3Q9NY84 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
VNN3Q9NY84 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
VNN3Q9NY84 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
VNN3Q9NY84 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
VNN3Q9NY84 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
VNN3Q9NY84 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
VNN3Q9NY84 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
VNN3Q9NY84 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
VNN3Q9NY84 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
VNN3Q9NY84 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
VNN3Q9NY84 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
VNN3Q9NY84 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
VNN3Q9NY84 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
VNN3Q9NY84 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
VNN3Q9NY84 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
VNN3Q9NY84 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
VNN3Q9NY84 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
VNN3Q9NY84 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
VNN3Q9NY84 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
VNN3Q9NY84 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
VNN3Q9NY84 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
VNN3Q9NY84 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
VNN3Q9NY84 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
VNN3Q9NY84 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
VNN3Q9NY84 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
VNN3Q9NY84 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
VNN3Q9NY84 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
VNN3Q9NY84 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
VNN3Q9NY84 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
VNN3Q9NY84 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
VNN3Q9NY84 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
VNN3Q9NY84 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
VNN3Q9NY84 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
VNN3Q9NY84 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
VNN3Q9NY84 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
VNN3Q9NY84 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
VNN3Q9NY84 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
VNN3Q9NY84 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
VNN3Q9NY84 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
VNN3Q9NY84 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
VNN3Q9NY84 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
VNN3Q9NY84 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
VNN3Q9NY84 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
VNN3Q9NY84 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
VNN3Q9NY84 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
VNN3Q9NY84 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
VNN3Q9NY84 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
VNN3Q9NY84 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
VNN3Q9NY84 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
VNN3Q9NY84 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC19.48■□□□□ 0.71
VNN3Q9NY84 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
VNN3Q9NY84 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
VNN3Q9NY84 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
VNN3Q9NY84 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
VNN3Q9NY84 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
VNN3Q9NY84 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
VNN3Q9NY84 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
VNN3Q9NY84 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
VNN3Q9NY84 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
VNN3Q9NY84 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
VNN3Q9NY84 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
VNN3Q9NY84 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
VNN3Q9NY84 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
VNN3Q9NY84 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
VNN3Q9NY84 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
VNN3Q9NY84 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
VNN3Q9NY84 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
VNN3Q9NY84 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
VNN3Q9NY84 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
VNN3Q9NY84 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
VNN3Q9NY84 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
VNN3Q9NY84 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
VNN3Q9NY84 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
VNN3Q9NY84 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
VNN3Q9NY84 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC19.47■□□□□ 0.71
VNN3Q9NY84 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
VNN3Q9NY84 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
VNN3Q9NY84 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
VNN3Q9NY84 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
VNN3Q9NY84 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
VNN3Q9NY84 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
VNN3Q9NY84 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
VNN3Q9NY84 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
VNN3Q9NY84 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
VNN3Q9NY84 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
VNN3Q9NY84 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
VNN3Q9NY84 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
VNN3Q9NY84 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms