Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX78

TMEM260, Transmembrane protein 260, humanhuman

Predictions only

Length 707 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM260Q9NX78 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TMEM260Q9NX78 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TMEM260Q9NX78 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TMEM260Q9NX78 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TMEM260Q9NX78 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TMEM260Q9NX78 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TMEM260Q9NX78 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TMEM260Q9NX78 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TMEM260Q9NX78 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TMEM260Q9NX78 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TMEM260Q9NX78 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TMEM260Q9NX78 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TMEM260Q9NX78 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TMEM260Q9NX78 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TMEM260Q9NX78 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TMEM260Q9NX78 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TMEM260Q9NX78 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TMEM260Q9NX78 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TMEM260Q9NX78 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TMEM260Q9NX78 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TMEM260Q9NX78 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TMEM260Q9NX78 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TMEM260Q9NX78 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TMEM260Q9NX78 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TMEM260Q9NX78 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TMEM260Q9NX78 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TMEM260Q9NX78 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TMEM260Q9NX78 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TMEM260Q9NX78 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TMEM260Q9NX78 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TMEM260Q9NX78 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TMEM260Q9NX78 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TMEM260Q9NX78 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TMEM260Q9NX78 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TMEM260Q9NX78 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TMEM260Q9NX78 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TMEM260Q9NX78 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TMEM260Q9NX78 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TMEM260Q9NX78 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TMEM260Q9NX78 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TMEM260Q9NX78 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TMEM260Q9NX78 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
TMEM260Q9NX78 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TMEM260Q9NX78 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TMEM260Q9NX78 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TMEM260Q9NX78 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TMEM260Q9NX78 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TMEM260Q9NX78 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TMEM260Q9NX78 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TMEM260Q9NX78 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TMEM260Q9NX78 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TMEM260Q9NX78 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TMEM260Q9NX78 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TMEM260Q9NX78 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TMEM260Q9NX78 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TMEM260Q9NX78 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TMEM260Q9NX78 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TMEM260Q9NX78 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TMEM260Q9NX78 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TMEM260Q9NX78 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TMEM260Q9NX78 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TMEM260Q9NX78 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
TMEM260Q9NX78 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TMEM260Q9NX78 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TMEM260Q9NX78 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TMEM260Q9NX78 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
TMEM260Q9NX78 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
TMEM260Q9NX78 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
TMEM260Q9NX78 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
TMEM260Q9NX78 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TMEM260Q9NX78 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TMEM260Q9NX78 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TMEM260Q9NX78 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TMEM260Q9NX78 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TMEM260Q9NX78 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TMEM260Q9NX78 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TMEM260Q9NX78 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TMEM260Q9NX78 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TMEM260Q9NX78 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TMEM260Q9NX78 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TMEM260Q9NX78 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TMEM260Q9NX78 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TMEM260Q9NX78 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TMEM260Q9NX78 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TMEM260Q9NX78 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TMEM260Q9NX78 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TMEM260Q9NX78 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TMEM260Q9NX78 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TMEM260Q9NX78 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TMEM260Q9NX78 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TMEM260Q9NX78 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TMEM260Q9NX78 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TMEM260Q9NX78 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TMEM260Q9NX78 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TMEM260Q9NX78 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TMEM260Q9NX78 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TMEM260Q9NX78 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TMEM260Q9NX78 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TMEM260Q9NX78 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
TMEM260Q9NX78 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.2 ms