Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX57

RAB20, Ras-related protein Rab-20, humanhuman

Predictions only

Length 234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB20Q9NX57 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RAB20Q9NX57 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RAB20Q9NX57 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RAB20Q9NX57 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RAB20Q9NX57 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RAB20Q9NX57 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RAB20Q9NX57 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RAB20Q9NX57 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RAB20Q9NX57 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RAB20Q9NX57 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RAB20Q9NX57 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RAB20Q9NX57 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RAB20Q9NX57 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RAB20Q9NX57 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RAB20Q9NX57 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
RAB20Q9NX57 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RAB20Q9NX57 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RAB20Q9NX57 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RAB20Q9NX57 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RAB20Q9NX57 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RAB20Q9NX57 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
RAB20Q9NX57 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RAB20Q9NX57 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RAB20Q9NX57 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RAB20Q9NX57 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RAB20Q9NX57 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RAB20Q9NX57 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RAB20Q9NX57 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RAB20Q9NX57 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RAB20Q9NX57 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
RAB20Q9NX57 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RAB20Q9NX57 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RAB20Q9NX57 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RAB20Q9NX57 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RAB20Q9NX57 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RAB20Q9NX57 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RAB20Q9NX57 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RAB20Q9NX57 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RAB20Q9NX57 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RAB20Q9NX57 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RAB20Q9NX57 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RAB20Q9NX57 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RAB20Q9NX57 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RAB20Q9NX57 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RAB20Q9NX57 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RAB20Q9NX57 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RAB20Q9NX57 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RAB20Q9NX57 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RAB20Q9NX57 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RAB20Q9NX57 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RAB20Q9NX57 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RAB20Q9NX57 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RAB20Q9NX57 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RAB20Q9NX57 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RAB20Q9NX57 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RAB20Q9NX57 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RAB20Q9NX57 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RAB20Q9NX57 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
RAB20Q9NX57 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RAB20Q9NX57 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RAB20Q9NX57 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RAB20Q9NX57 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RAB20Q9NX57 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RAB20Q9NX57 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RAB20Q9NX57 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RAB20Q9NX57 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RAB20Q9NX57 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RAB20Q9NX57 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RAB20Q9NX57 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RAB20Q9NX57 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
RAB20Q9NX57 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RAB20Q9NX57 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RAB20Q9NX57 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RAB20Q9NX57 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RAB20Q9NX57 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RAB20Q9NX57 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RAB20Q9NX57 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
RAB20Q9NX57 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RAB20Q9NX57 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RAB20Q9NX57 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RAB20Q9NX57 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RAB20Q9NX57 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RAB20Q9NX57 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RAB20Q9NX57 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RAB20Q9NX57 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RAB20Q9NX57 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RAB20Q9NX57 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RAB20Q9NX57 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RAB20Q9NX57 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RAB20Q9NX57 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
RAB20Q9NX57 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RAB20Q9NX57 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RAB20Q9NX57 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RAB20Q9NX57 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RAB20Q9NX57 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RAB20Q9NX57 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RAB20Q9NX57 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RAB20Q9NX57 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RAB20Q9NX57 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RAB20Q9NX57 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.2 ms