Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX47

MARCH5, E3 ubiquitin-protein ligase MARCH5, humanhuman

Predictions only

Length 278 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MARCH5Q9NX47 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MARCH5Q9NX47 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
MARCH5Q9NX47 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MARCH5Q9NX47 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
MARCH5Q9NX47 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MARCH5Q9NX47 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
MARCH5Q9NX47 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
MARCH5Q9NX47 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
MARCH5Q9NX47 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
MARCH5Q9NX47 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
MARCH5Q9NX47 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
MARCH5Q9NX47 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
MARCH5Q9NX47 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
MARCH5Q9NX47 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
MARCH5Q9NX47 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
MARCH5Q9NX47 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
MARCH5Q9NX47 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MARCH5Q9NX47 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
MARCH5Q9NX47 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
MARCH5Q9NX47 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
MARCH5Q9NX47 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
MARCH5Q9NX47 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
MARCH5Q9NX47 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
MARCH5Q9NX47 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
MARCH5Q9NX47 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
MARCH5Q9NX47 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
MARCH5Q9NX47 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
MARCH5Q9NX47 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
MARCH5Q9NX47 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
MARCH5Q9NX47 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
MARCH5Q9NX47 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
MARCH5Q9NX47 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
MARCH5Q9NX47 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
MARCH5Q9NX47 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
MARCH5Q9NX47 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MARCH5Q9NX47 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
MARCH5Q9NX47 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MARCH5Q9NX47 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MARCH5Q9NX47 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
MARCH5Q9NX47 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC22.46■■□□□ 1.19
MARCH5Q9NX47 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
MARCH5Q9NX47 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC22.46■■□□□ 1.19
MARCH5Q9NX47 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MARCH5Q9NX47 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
MARCH5Q9NX47 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MARCH5Q9NX47 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
MARCH5Q9NX47 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
MARCH5Q9NX47 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
MARCH5Q9NX47 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
MARCH5Q9NX47 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
MARCH5Q9NX47 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
MARCH5Q9NX47 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
MARCH5Q9NX47 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
MARCH5Q9NX47 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
MARCH5Q9NX47 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
MARCH5Q9NX47 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
MARCH5Q9NX47 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
MARCH5Q9NX47 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
MARCH5Q9NX47 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
MARCH5Q9NX47 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
MARCH5Q9NX47 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
MARCH5Q9NX47 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
MARCH5Q9NX47 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
MARCH5Q9NX47 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
MARCH5Q9NX47 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
MARCH5Q9NX47 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
MARCH5Q9NX47 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
MARCH5Q9NX47 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
MARCH5Q9NX47 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
MARCH5Q9NX47 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
MARCH5Q9NX47 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
MARCH5Q9NX47 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
MARCH5Q9NX47 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
MARCH5Q9NX47 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
MARCH5Q9NX47 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MARCH5Q9NX47 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
MARCH5Q9NX47 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MARCH5Q9NX47 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
MARCH5Q9NX47 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
MARCH5Q9NX47 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
MARCH5Q9NX47 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MARCH5Q9NX47 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
MARCH5Q9NX47 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
MARCH5Q9NX47 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC22.43■■□□□ 1.18
MARCH5Q9NX47 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
MARCH5Q9NX47 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MARCH5Q9NX47 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
MARCH5Q9NX47 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
MARCH5Q9NX47 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MARCH5Q9NX47 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
MARCH5Q9NX47 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MARCH5Q9NX47 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
MARCH5Q9NX47 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
MARCH5Q9NX47 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
MARCH5Q9NX47 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
MARCH5Q9NX47 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MARCH5Q9NX47 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MARCH5Q9NX47 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
MARCH5Q9NX47 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MARCH5Q9NX47 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms