Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVU0

POLR3E, DNA-directed RNA polymerase III subunit RPC5, humanhuman

Predictions only

Length 708 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR3EQ9NVU0 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
POLR3EQ9NVU0 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
POLR3EQ9NVU0 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
POLR3EQ9NVU0 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
POLR3EQ9NVU0 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
POLR3EQ9NVU0 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
POLR3EQ9NVU0 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC24.52■■□□□ 1.52
POLR3EQ9NVU0 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
POLR3EQ9NVU0 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
POLR3EQ9NVU0 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
POLR3EQ9NVU0 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
POLR3EQ9NVU0 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
POLR3EQ9NVU0 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
POLR3EQ9NVU0 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
POLR3EQ9NVU0 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
POLR3EQ9NVU0 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
POLR3EQ9NVU0 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
POLR3EQ9NVU0 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
POLR3EQ9NVU0 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
POLR3EQ9NVU0 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
POLR3EQ9NVU0 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
POLR3EQ9NVU0 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
POLR3EQ9NVU0 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
POLR3EQ9NVU0 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
POLR3EQ9NVU0 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
POLR3EQ9NVU0 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
POLR3EQ9NVU0 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
POLR3EQ9NVU0 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
POLR3EQ9NVU0 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
POLR3EQ9NVU0 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
POLR3EQ9NVU0 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
POLR3EQ9NVU0 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
POLR3EQ9NVU0 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
POLR3EQ9NVU0 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
POLR3EQ9NVU0 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
POLR3EQ9NVU0 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
POLR3EQ9NVU0 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
POLR3EQ9NVU0 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
POLR3EQ9NVU0 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
POLR3EQ9NVU0 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
POLR3EQ9NVU0 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
POLR3EQ9NVU0 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
POLR3EQ9NVU0 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
POLR3EQ9NVU0 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
POLR3EQ9NVU0 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
POLR3EQ9NVU0 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
POLR3EQ9NVU0 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
POLR3EQ9NVU0 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC24.49■■□□□ 1.51
POLR3EQ9NVU0 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
POLR3EQ9NVU0 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
POLR3EQ9NVU0 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
POLR3EQ9NVU0 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
POLR3EQ9NVU0 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
POLR3EQ9NVU0 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
POLR3EQ9NVU0 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
POLR3EQ9NVU0 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
POLR3EQ9NVU0 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
POLR3EQ9NVU0 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
POLR3EQ9NVU0 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
POLR3EQ9NVU0 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
POLR3EQ9NVU0 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
POLR3EQ9NVU0 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
POLR3EQ9NVU0 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
POLR3EQ9NVU0 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
POLR3EQ9NVU0 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
POLR3EQ9NVU0 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
POLR3EQ9NVU0 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
POLR3EQ9NVU0 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
POLR3EQ9NVU0 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
POLR3EQ9NVU0 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
POLR3EQ9NVU0 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
POLR3EQ9NVU0 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
POLR3EQ9NVU0 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
POLR3EQ9NVU0 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
POLR3EQ9NVU0 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
POLR3EQ9NVU0 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
POLR3EQ9NVU0 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
POLR3EQ9NVU0 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
POLR3EQ9NVU0 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
POLR3EQ9NVU0 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC24.46■■□□□ 1.51
POLR3EQ9NVU0 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
POLR3EQ9NVU0 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
POLR3EQ9NVU0 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
POLR3EQ9NVU0 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
POLR3EQ9NVU0 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
POLR3EQ9NVU0 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
POLR3EQ9NVU0 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
POLR3EQ9NVU0 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
POLR3EQ9NVU0 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
POLR3EQ9NVU0 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
POLR3EQ9NVU0 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
POLR3EQ9NVU0 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
POLR3EQ9NVU0 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
POLR3EQ9NVU0 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
POLR3EQ9NVU0 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
POLR3EQ9NVU0 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
POLR3EQ9NVU0 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
POLR3EQ9NVU0 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
POLR3EQ9NVU0 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
POLR3EQ9NVU0 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.1 ms