Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVF7

FBXO28, F-box only protein 28, humanhuman

Predictions only

Length 368 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXO28Q9NVF7 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
FBXO28Q9NVF7 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
FBXO28Q9NVF7 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
FBXO28Q9NVF7 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
FBXO28Q9NVF7 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC24.38■■□□□ 1.49
FBXO28Q9NVF7 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
FBXO28Q9NVF7 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
FBXO28Q9NVF7 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
FBXO28Q9NVF7 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
FBXO28Q9NVF7 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
FBXO28Q9NVF7 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
FBXO28Q9NVF7 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
FBXO28Q9NVF7 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
FBXO28Q9NVF7 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
FBXO28Q9NVF7 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
FBXO28Q9NVF7 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
FBXO28Q9NVF7 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
FBXO28Q9NVF7 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
FBXO28Q9NVF7 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
FBXO28Q9NVF7 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
FBXO28Q9NVF7 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
FBXO28Q9NVF7 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
FBXO28Q9NVF7 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
FBXO28Q9NVF7 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
FBXO28Q9NVF7 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
FBXO28Q9NVF7 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
FBXO28Q9NVF7 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
FBXO28Q9NVF7 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
FBXO28Q9NVF7 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
FBXO28Q9NVF7 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
FBXO28Q9NVF7 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
FBXO28Q9NVF7 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
FBXO28Q9NVF7 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
FBXO28Q9NVF7 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
FBXO28Q9NVF7 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
FBXO28Q9NVF7 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
FBXO28Q9NVF7 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
FBXO28Q9NVF7 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
FBXO28Q9NVF7 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
FBXO28Q9NVF7 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
FBXO28Q9NVF7 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
FBXO28Q9NVF7 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
FBXO28Q9NVF7 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
FBXO28Q9NVF7 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
FBXO28Q9NVF7 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
FBXO28Q9NVF7 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
FBXO28Q9NVF7 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
FBXO28Q9NVF7 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
FBXO28Q9NVF7 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
FBXO28Q9NVF7 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
FBXO28Q9NVF7 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
FBXO28Q9NVF7 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
FBXO28Q9NVF7 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
FBXO28Q9NVF7 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
FBXO28Q9NVF7 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
FBXO28Q9NVF7 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
FBXO28Q9NVF7 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
FBXO28Q9NVF7 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
FBXO28Q9NVF7 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
FBXO28Q9NVF7 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
FBXO28Q9NVF7 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
FBXO28Q9NVF7 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
FBXO28Q9NVF7 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
FBXO28Q9NVF7 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
FBXO28Q9NVF7 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
FBXO28Q9NVF7 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
FBXO28Q9NVF7 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
FBXO28Q9NVF7 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
FBXO28Q9NVF7 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
FBXO28Q9NVF7 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC24.33■■□□□ 1.48
FBXO28Q9NVF7 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
FBXO28Q9NVF7 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
FBXO28Q9NVF7 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.48
FBXO28Q9NVF7 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
FBXO28Q9NVF7 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
FBXO28Q9NVF7 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
FBXO28Q9NVF7 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
FBXO28Q9NVF7 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
FBXO28Q9NVF7 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
FBXO28Q9NVF7 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
FBXO28Q9NVF7 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
FBXO28Q9NVF7 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
FBXO28Q9NVF7 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
FBXO28Q9NVF7 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
FBXO28Q9NVF7 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
FBXO28Q9NVF7 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
FBXO28Q9NVF7 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
FBXO28Q9NVF7 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
FBXO28Q9NVF7 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
FBXO28Q9NVF7 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
FBXO28Q9NVF7 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
FBXO28Q9NVF7 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
FBXO28Q9NVF7 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
FBXO28Q9NVF7 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
FBXO28Q9NVF7 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
FBXO28Q9NVF7 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
FBXO28Q9NVF7 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
FBXO28Q9NVF7 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC24.31■■□□□ 1.48
FBXO28Q9NVF7 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
FBXO28Q9NVF7 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms