Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUV7

SPTLC3, Serine palmitoyltransferase 3, humanhuman

Predictions only

Length 552 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTLC3Q9NUV7 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SPTLC3Q9NUV7 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SPTLC3Q9NUV7 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SPTLC3Q9NUV7 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SPTLC3Q9NUV7 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SPTLC3Q9NUV7 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SPTLC3Q9NUV7 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SPTLC3Q9NUV7 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SPTLC3Q9NUV7 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SPTLC3Q9NUV7 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SPTLC3Q9NUV7 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SPTLC3Q9NUV7 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SPTLC3Q9NUV7 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SPTLC3Q9NUV7 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SPTLC3Q9NUV7 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SPTLC3Q9NUV7 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SPTLC3Q9NUV7 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SPTLC3Q9NUV7 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SPTLC3Q9NUV7 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SPTLC3Q9NUV7 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SPTLC3Q9NUV7 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SPTLC3Q9NUV7 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SPTLC3Q9NUV7 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SPTLC3Q9NUV7 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SPTLC3Q9NUV7 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SPTLC3Q9NUV7 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SPTLC3Q9NUV7 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SPTLC3Q9NUV7 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SPTLC3Q9NUV7 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SPTLC3Q9NUV7 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SPTLC3Q9NUV7 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SPTLC3Q9NUV7 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SPTLC3Q9NUV7 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SPTLC3Q9NUV7 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SPTLC3Q9NUV7 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SPTLC3Q9NUV7 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SPTLC3Q9NUV7 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SPTLC3Q9NUV7 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SPTLC3Q9NUV7 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SPTLC3Q9NUV7 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SPTLC3Q9NUV7 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SPTLC3Q9NUV7 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
SPTLC3Q9NUV7 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SPTLC3Q9NUV7 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
SPTLC3Q9NUV7 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
SPTLC3Q9NUV7 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SPTLC3Q9NUV7 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SPTLC3Q9NUV7 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SPTLC3Q9NUV7 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SPTLC3Q9NUV7 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SPTLC3Q9NUV7 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SPTLC3Q9NUV7 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
SPTLC3Q9NUV7 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SPTLC3Q9NUV7 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SPTLC3Q9NUV7 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SPTLC3Q9NUV7 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SPTLC3Q9NUV7 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SPTLC3Q9NUV7 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SPTLC3Q9NUV7 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SPTLC3Q9NUV7 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SPTLC3Q9NUV7 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SPTLC3Q9NUV7 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SPTLC3Q9NUV7 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SPTLC3Q9NUV7 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SPTLC3Q9NUV7 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SPTLC3Q9NUV7 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
SPTLC3Q9NUV7 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SPTLC3Q9NUV7 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SPTLC3Q9NUV7 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SPTLC3Q9NUV7 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SPTLC3Q9NUV7 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
SPTLC3Q9NUV7 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SPTLC3Q9NUV7 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SPTLC3Q9NUV7 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SPTLC3Q9NUV7 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SPTLC3Q9NUV7 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SPTLC3Q9NUV7 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SPTLC3Q9NUV7 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SPTLC3Q9NUV7 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SPTLC3Q9NUV7 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SPTLC3Q9NUV7 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SPTLC3Q9NUV7 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SPTLC3Q9NUV7 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SPTLC3Q9NUV7 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SPTLC3Q9NUV7 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SPTLC3Q9NUV7 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SPTLC3Q9NUV7 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SPTLC3Q9NUV7 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SPTLC3Q9NUV7 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SPTLC3Q9NUV7 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
SPTLC3Q9NUV7 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
SPTLC3Q9NUV7 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
SPTLC3Q9NUV7 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
SPTLC3Q9NUV7 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SPTLC3Q9NUV7 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SPTLC3Q9NUV7 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SPTLC3Q9NUV7 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
SPTLC3Q9NUV7 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
SPTLC3Q9NUV7 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
SPTLC3Q9NUV7 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms