Protein–RNA interactions for Protein: Q9NT22

EMILIN3, EMILIN-3, humanhuman

Predictions only

Length 766 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EMILIN3Q9NT22 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
EMILIN3Q9NT22 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
EMILIN3Q9NT22 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
EMILIN3Q9NT22 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
EMILIN3Q9NT22 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
EMILIN3Q9NT22 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC24.6■■□□□ 1.53
EMILIN3Q9NT22 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
EMILIN3Q9NT22 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
EMILIN3Q9NT22 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
EMILIN3Q9NT22 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
EMILIN3Q9NT22 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
EMILIN3Q9NT22 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
EMILIN3Q9NT22 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
EMILIN3Q9NT22 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
EMILIN3Q9NT22 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
EMILIN3Q9NT22 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
EMILIN3Q9NT22 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
EMILIN3Q9NT22 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
EMILIN3Q9NT22 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
EMILIN3Q9NT22 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
EMILIN3Q9NT22 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
EMILIN3Q9NT22 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
EMILIN3Q9NT22 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
EMILIN3Q9NT22 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
EMILIN3Q9NT22 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
EMILIN3Q9NT22 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
EMILIN3Q9NT22 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
EMILIN3Q9NT22 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
EMILIN3Q9NT22 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
EMILIN3Q9NT22 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
EMILIN3Q9NT22 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
EMILIN3Q9NT22 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
EMILIN3Q9NT22 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
EMILIN3Q9NT22 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
EMILIN3Q9NT22 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
EMILIN3Q9NT22 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
EMILIN3Q9NT22 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
EMILIN3Q9NT22 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
EMILIN3Q9NT22 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
EMILIN3Q9NT22 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
EMILIN3Q9NT22 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
EMILIN3Q9NT22 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
EMILIN3Q9NT22 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
EMILIN3Q9NT22 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
EMILIN3Q9NT22 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
EMILIN3Q9NT22 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
EMILIN3Q9NT22 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
EMILIN3Q9NT22 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
EMILIN3Q9NT22 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
EMILIN3Q9NT22 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
EMILIN3Q9NT22 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
EMILIN3Q9NT22 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
EMILIN3Q9NT22 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
EMILIN3Q9NT22 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
EMILIN3Q9NT22 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
EMILIN3Q9NT22 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
EMILIN3Q9NT22 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
EMILIN3Q9NT22 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
EMILIN3Q9NT22 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
EMILIN3Q9NT22 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC24.56■■□□□ 1.52
EMILIN3Q9NT22 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
EMILIN3Q9NT22 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
EMILIN3Q9NT22 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
EMILIN3Q9NT22 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
EMILIN3Q9NT22 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
EMILIN3Q9NT22 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
EMILIN3Q9NT22 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
EMILIN3Q9NT22 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
EMILIN3Q9NT22 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
EMILIN3Q9NT22 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
EMILIN3Q9NT22 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
EMILIN3Q9NT22 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
EMILIN3Q9NT22 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
EMILIN3Q9NT22 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
EMILIN3Q9NT22 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
EMILIN3Q9NT22 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
EMILIN3Q9NT22 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
EMILIN3Q9NT22 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
EMILIN3Q9NT22 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
EMILIN3Q9NT22 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
EMILIN3Q9NT22 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
EMILIN3Q9NT22 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
EMILIN3Q9NT22 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
EMILIN3Q9NT22 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
EMILIN3Q9NT22 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
EMILIN3Q9NT22 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
EMILIN3Q9NT22 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
EMILIN3Q9NT22 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
EMILIN3Q9NT22 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
EMILIN3Q9NT22 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
EMILIN3Q9NT22 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
EMILIN3Q9NT22 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
EMILIN3Q9NT22 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
EMILIN3Q9NT22 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
EMILIN3Q9NT22 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC24.53■■□□□ 1.52
EMILIN3Q9NT22 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC24.53■■□□□ 1.52
EMILIN3Q9NT22 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
EMILIN3Q9NT22 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
EMILIN3Q9NT22 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
EMILIN3Q9NT22 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.4 ms