Protein–RNA interactions for Protein: Q9NS93

TM7SF3, Transmembrane 7 superfamily member 3, humanhuman

Predictions only

Length 570 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM7SF3Q9NS93 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
TM7SF3Q9NS93 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
TM7SF3Q9NS93 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
TM7SF3Q9NS93 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
TM7SF3Q9NS93 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
TM7SF3Q9NS93 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
TM7SF3Q9NS93 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
TM7SF3Q9NS93 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
TM7SF3Q9NS93 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
TM7SF3Q9NS93 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
TM7SF3Q9NS93 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
TM7SF3Q9NS93 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
TM7SF3Q9NS93 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
TM7SF3Q9NS93 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
TM7SF3Q9NS93 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
TM7SF3Q9NS93 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
TM7SF3Q9NS93 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
TM7SF3Q9NS93 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
TM7SF3Q9NS93 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
TM7SF3Q9NS93 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
TM7SF3Q9NS93 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
TM7SF3Q9NS93 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
TM7SF3Q9NS93 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
TM7SF3Q9NS93 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
TM7SF3Q9NS93 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
TM7SF3Q9NS93 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
TM7SF3Q9NS93 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
TM7SF3Q9NS93 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
TM7SF3Q9NS93 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
TM7SF3Q9NS93 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
TM7SF3Q9NS93 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
TM7SF3Q9NS93 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC20.96■□□□□ 0.95
TM7SF3Q9NS93 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
TM7SF3Q9NS93 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
TM7SF3Q9NS93 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC20.95■□□□□ 0.95
TM7SF3Q9NS93 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
TM7SF3Q9NS93 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
TM7SF3Q9NS93 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
TM7SF3Q9NS93 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
TM7SF3Q9NS93 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
TM7SF3Q9NS93 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
TM7SF3Q9NS93 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
TM7SF3Q9NS93 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
TM7SF3Q9NS93 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
TM7SF3Q9NS93 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
TM7SF3Q9NS93 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
TM7SF3Q9NS93 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
TM7SF3Q9NS93 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
TM7SF3Q9NS93 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
TM7SF3Q9NS93 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
TM7SF3Q9NS93 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
TM7SF3Q9NS93 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
TM7SF3Q9NS93 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
TM7SF3Q9NS93 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
TM7SF3Q9NS93 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
TM7SF3Q9NS93 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
TM7SF3Q9NS93 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
TM7SF3Q9NS93 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
TM7SF3Q9NS93 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
TM7SF3Q9NS93 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
TM7SF3Q9NS93 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
TM7SF3Q9NS93 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
TM7SF3Q9NS93 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
TM7SF3Q9NS93 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
TM7SF3Q9NS93 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
TM7SF3Q9NS93 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
TM7SF3Q9NS93 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
TM7SF3Q9NS93 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
TM7SF3Q9NS93 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
TM7SF3Q9NS93 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
TM7SF3Q9NS93 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
TM7SF3Q9NS93 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
TM7SF3Q9NS93 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
TM7SF3Q9NS93 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
TM7SF3Q9NS93 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
TM7SF3Q9NS93 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
TM7SF3Q9NS93 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
TM7SF3Q9NS93 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC20.93■□□□□ 0.94
TM7SF3Q9NS93 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
TM7SF3Q9NS93 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
TM7SF3Q9NS93 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
TM7SF3Q9NS93 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
TM7SF3Q9NS93 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
TM7SF3Q9NS93 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
TM7SF3Q9NS93 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
TM7SF3Q9NS93 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
TM7SF3Q9NS93 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
TM7SF3Q9NS93 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
TM7SF3Q9NS93 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
TM7SF3Q9NS93 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
TM7SF3Q9NS93 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
TM7SF3Q9NS93 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
TM7SF3Q9NS93 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
TM7SF3Q9NS93 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
TM7SF3Q9NS93 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
TM7SF3Q9NS93 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
TM7SF3Q9NS93 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
TM7SF3Q9NS93 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
TM7SF3Q9NS93 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
TM7SF3Q9NS93 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms